Protein–RNA interactions for Protein: Q15628

TRADD, Tumor necrosis factor receptor type 1-associated DEATH domain protein, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRADDQ15628 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TRADDQ15628 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TRADDQ15628 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TRADDQ15628 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TRADDQ15628 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TRADDQ15628 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TRADDQ15628 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
TRADDQ15628 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TRADDQ15628 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TRADDQ15628 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TRADDQ15628 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TRADDQ15628 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TRADDQ15628 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TRADDQ15628 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TRADDQ15628 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TRADDQ15628 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
TRADDQ15628 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TRADDQ15628 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TRADDQ15628 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TRADDQ15628 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TRADDQ15628 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TRADDQ15628 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TRADDQ15628 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TRADDQ15628 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TRADDQ15628 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TRADDQ15628 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TRADDQ15628 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TRADDQ15628 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TRADDQ15628 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TRADDQ15628 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TRADDQ15628 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TRADDQ15628 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TRADDQ15628 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TRADDQ15628 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TRADDQ15628 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TRADDQ15628 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TRADDQ15628 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TRADDQ15628 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TRADDQ15628 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TRADDQ15628 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TRADDQ15628 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TRADDQ15628 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TRADDQ15628 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TRADDQ15628 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TRADDQ15628 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TRADDQ15628 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TRADDQ15628 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TRADDQ15628 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
TRADDQ15628 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TRADDQ15628 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TRADDQ15628 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TRADDQ15628 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TRADDQ15628 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TRADDQ15628 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TRADDQ15628 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TRADDQ15628 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TRADDQ15628 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TRADDQ15628 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TRADDQ15628 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TRADDQ15628 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TRADDQ15628 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TRADDQ15628 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TRADDQ15628 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TRADDQ15628 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TRADDQ15628 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
TRADDQ15628 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TRADDQ15628 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
TRADDQ15628 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TRADDQ15628 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TRADDQ15628 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TRADDQ15628 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TRADDQ15628 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TRADDQ15628 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TRADDQ15628 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TRADDQ15628 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TRADDQ15628 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TRADDQ15628 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TRADDQ15628 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TRADDQ15628 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TRADDQ15628 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TRADDQ15628 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TRADDQ15628 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TRADDQ15628 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TRADDQ15628 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TRADDQ15628 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TRADDQ15628 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TRADDQ15628 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
TRADDQ15628 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TRADDQ15628 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TRADDQ15628 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TRADDQ15628 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TRADDQ15628 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TRADDQ15628 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
TRADDQ15628 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
TRADDQ15628 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
TRADDQ15628 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TRADDQ15628 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TRADDQ15628 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TRADDQ15628 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TRADDQ15628 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
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