Protein–RNA interactions for Protein: Q15276

RABEP1, Rab GTPase-binding effector protein 1, humanhuman

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Length 862 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABEP1Q15276 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RABEP1Q15276 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RABEP1Q15276 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RABEP1Q15276 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
RABEP1Q15276 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RABEP1Q15276 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RABEP1Q15276 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RABEP1Q15276 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RABEP1Q15276 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RABEP1Q15276 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RABEP1Q15276 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RABEP1Q15276 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RABEP1Q15276 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
RABEP1Q15276 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
RABEP1Q15276 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RABEP1Q15276 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RABEP1Q15276 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RABEP1Q15276 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RABEP1Q15276 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RABEP1Q15276 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RABEP1Q15276 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RABEP1Q15276 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RABEP1Q15276 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RABEP1Q15276 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RABEP1Q15276 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RABEP1Q15276 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RABEP1Q15276 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RABEP1Q15276 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RABEP1Q15276 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RABEP1Q15276 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RABEP1Q15276 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RABEP1Q15276 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RABEP1Q15276 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RABEP1Q15276 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RABEP1Q15276 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RABEP1Q15276 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RABEP1Q15276 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RABEP1Q15276 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RABEP1Q15276 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RABEP1Q15276 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RABEP1Q15276 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RABEP1Q15276 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RABEP1Q15276 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RABEP1Q15276 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RABEP1Q15276 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RABEP1Q15276 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RABEP1Q15276 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RABEP1Q15276 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RABEP1Q15276 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RABEP1Q15276 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RABEP1Q15276 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RABEP1Q15276 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RABEP1Q15276 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RABEP1Q15276 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RABEP1Q15276 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RABEP1Q15276 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RABEP1Q15276 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RABEP1Q15276 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RABEP1Q15276 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RABEP1Q15276 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RABEP1Q15276 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RABEP1Q15276 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RABEP1Q15276 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RABEP1Q15276 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RABEP1Q15276 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
RABEP1Q15276 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RABEP1Q15276 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RABEP1Q15276 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RABEP1Q15276 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RABEP1Q15276 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RABEP1Q15276 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RABEP1Q15276 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RABEP1Q15276 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RABEP1Q15276 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RABEP1Q15276 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RABEP1Q15276 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RABEP1Q15276 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RABEP1Q15276 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RABEP1Q15276 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RABEP1Q15276 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
RABEP1Q15276 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RABEP1Q15276 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RABEP1Q15276 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
RABEP1Q15276 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RABEP1Q15276 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RABEP1Q15276 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RABEP1Q15276 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RABEP1Q15276 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RABEP1Q15276 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RABEP1Q15276 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RABEP1Q15276 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RABEP1Q15276 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RABEP1Q15276 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RABEP1Q15276 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RABEP1Q15276 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RABEP1Q15276 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RABEP1Q15276 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RABEP1Q15276 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RABEP1Q15276 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RABEP1Q15276 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
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