Protein–RNA interactions for Protein: Q15223

NECTIN1, Nectin-1, humanhuman

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NECTIN1Q15223 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NECTIN1Q15223 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
NECTIN1Q15223 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NECTIN1Q15223 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
NECTIN1Q15223 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NECTIN1Q15223 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NECTIN1Q15223 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NECTIN1Q15223 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
NECTIN1Q15223 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NECTIN1Q15223 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NECTIN1Q15223 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NECTIN1Q15223 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NECTIN1Q15223 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
NECTIN1Q15223 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NECTIN1Q15223 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NECTIN1Q15223 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NECTIN1Q15223 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NECTIN1Q15223 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NECTIN1Q15223 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NECTIN1Q15223 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NECTIN1Q15223 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NECTIN1Q15223 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NECTIN1Q15223 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NECTIN1Q15223 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
NECTIN1Q15223 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
NECTIN1Q15223 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NECTIN1Q15223 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NECTIN1Q15223 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
NECTIN1Q15223 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NECTIN1Q15223 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NECTIN1Q15223 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NECTIN1Q15223 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NECTIN1Q15223 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NECTIN1Q15223 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NECTIN1Q15223 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NECTIN1Q15223 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NECTIN1Q15223 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NECTIN1Q15223 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NECTIN1Q15223 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NECTIN1Q15223 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
NECTIN1Q15223 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NECTIN1Q15223 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NECTIN1Q15223 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NECTIN1Q15223 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NECTIN1Q15223 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NECTIN1Q15223 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NECTIN1Q15223 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NECTIN1Q15223 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NECTIN1Q15223 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
NECTIN1Q15223 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NECTIN1Q15223 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NECTIN1Q15223 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NECTIN1Q15223 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NECTIN1Q15223 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
NECTIN1Q15223 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
NECTIN1Q15223 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NECTIN1Q15223 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NECTIN1Q15223 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NECTIN1Q15223 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NECTIN1Q15223 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NECTIN1Q15223 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NECTIN1Q15223 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NECTIN1Q15223 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NECTIN1Q15223 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NECTIN1Q15223 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NECTIN1Q15223 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NECTIN1Q15223 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NECTIN1Q15223 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NECTIN1Q15223 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NECTIN1Q15223 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NECTIN1Q15223 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NECTIN1Q15223 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NECTIN1Q15223 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NECTIN1Q15223 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NECTIN1Q15223 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NECTIN1Q15223 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NECTIN1Q15223 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NECTIN1Q15223 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NECTIN1Q15223 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NECTIN1Q15223 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NECTIN1Q15223 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
NECTIN1Q15223 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NECTIN1Q15223 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NECTIN1Q15223 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NECTIN1Q15223 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NECTIN1Q15223 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NECTIN1Q15223 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NECTIN1Q15223 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NECTIN1Q15223 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NECTIN1Q15223 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NECTIN1Q15223 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NECTIN1Q15223 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NECTIN1Q15223 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NECTIN1Q15223 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NECTIN1Q15223 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NECTIN1Q15223 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NECTIN1Q15223 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NECTIN1Q15223 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NECTIN1Q15223 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NECTIN1Q15223 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
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