Protein–RNA interactions for Protein: Q15113

PCOLCE, Procollagen C-endopeptidase enhancer 1, humanhuman

Predictions only

Length 449 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCOLCEQ15113 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PCOLCEQ15113 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PCOLCEQ15113 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PCOLCEQ15113 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PCOLCEQ15113 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PCOLCEQ15113 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PCOLCEQ15113 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PCOLCEQ15113 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PCOLCEQ15113 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PCOLCEQ15113 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
PCOLCEQ15113 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PCOLCEQ15113 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PCOLCEQ15113 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PCOLCEQ15113 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PCOLCEQ15113 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PCOLCEQ15113 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PCOLCEQ15113 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PCOLCEQ15113 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PCOLCEQ15113 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PCOLCEQ15113 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PCOLCEQ15113 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PCOLCEQ15113 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PCOLCEQ15113 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PCOLCEQ15113 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PCOLCEQ15113 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PCOLCEQ15113 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PCOLCEQ15113 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PCOLCEQ15113 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PCOLCEQ15113 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PCOLCEQ15113 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PCOLCEQ15113 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PCOLCEQ15113 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PCOLCEQ15113 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
PCOLCEQ15113 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
PCOLCEQ15113 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
PCOLCEQ15113 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
PCOLCEQ15113 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PCOLCEQ15113 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PCOLCEQ15113 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PCOLCEQ15113 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PCOLCEQ15113 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
PCOLCEQ15113 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
PCOLCEQ15113 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PCOLCEQ15113 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PCOLCEQ15113 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PCOLCEQ15113 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PCOLCEQ15113 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PCOLCEQ15113 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PCOLCEQ15113 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PCOLCEQ15113 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PCOLCEQ15113 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PCOLCEQ15113 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PCOLCEQ15113 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PCOLCEQ15113 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PCOLCEQ15113 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PCOLCEQ15113 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PCOLCEQ15113 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PCOLCEQ15113 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PCOLCEQ15113 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PCOLCEQ15113 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PCOLCEQ15113 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PCOLCEQ15113 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PCOLCEQ15113 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PCOLCEQ15113 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PCOLCEQ15113 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PCOLCEQ15113 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PCOLCEQ15113 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PCOLCEQ15113 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PCOLCEQ15113 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PCOLCEQ15113 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PCOLCEQ15113 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PCOLCEQ15113 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PCOLCEQ15113 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
PCOLCEQ15113 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PCOLCEQ15113 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PCOLCEQ15113 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PCOLCEQ15113 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PCOLCEQ15113 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PCOLCEQ15113 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PCOLCEQ15113 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PCOLCEQ15113 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PCOLCEQ15113 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PCOLCEQ15113 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PCOLCEQ15113 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PCOLCEQ15113 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PCOLCEQ15113 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PCOLCEQ15113 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PCOLCEQ15113 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PCOLCEQ15113 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PCOLCEQ15113 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PCOLCEQ15113 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PCOLCEQ15113 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PCOLCEQ15113 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PCOLCEQ15113 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PCOLCEQ15113 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PCOLCEQ15113 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PCOLCEQ15113 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PCOLCEQ15113 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PCOLCEQ15113 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PCOLCEQ15113 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
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