Protein–RNA interactions for Protein: Q15075

EEA1, Early endosome antigen 1, humanhuman

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Length 1,411 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEA1Q15075 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
EEA1Q15075 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
EEA1Q15075 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
EEA1Q15075 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
EEA1Q15075 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
EEA1Q15075 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
EEA1Q15075 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC29.67■■■□□ 2.34
EEA1Q15075 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
EEA1Q15075 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC29.67■■■□□ 2.34
EEA1Q15075 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
EEA1Q15075 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
EEA1Q15075 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
EEA1Q15075 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
EEA1Q15075 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
EEA1Q15075 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
EEA1Q15075 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
EEA1Q15075 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
EEA1Q15075 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
EEA1Q15075 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
EEA1Q15075 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
EEA1Q15075 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
EEA1Q15075 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
EEA1Q15075 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
EEA1Q15075 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
EEA1Q15075 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
EEA1Q15075 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
EEA1Q15075 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
EEA1Q15075 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
EEA1Q15075 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
EEA1Q15075 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
EEA1Q15075 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
EEA1Q15075 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
EEA1Q15075 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
EEA1Q15075 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
EEA1Q15075 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
EEA1Q15075 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
EEA1Q15075 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
EEA1Q15075 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
EEA1Q15075 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
EEA1Q15075 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
EEA1Q15075 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
EEA1Q15075 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
EEA1Q15075 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
EEA1Q15075 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
EEA1Q15075 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
EEA1Q15075 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
EEA1Q15075 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
EEA1Q15075 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC29.65■■■□□ 2.34
EEA1Q15075 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
EEA1Q15075 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
EEA1Q15075 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
EEA1Q15075 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
EEA1Q15075 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
EEA1Q15075 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
EEA1Q15075 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
EEA1Q15075 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
EEA1Q15075 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
EEA1Q15075 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
EEA1Q15075 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
EEA1Q15075 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
EEA1Q15075 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
EEA1Q15075 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
EEA1Q15075 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
EEA1Q15075 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
EEA1Q15075 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
EEA1Q15075 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
EEA1Q15075 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
EEA1Q15075 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC29.64■■■□□ 2.34
EEA1Q15075 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
EEA1Q15075 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
EEA1Q15075 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
EEA1Q15075 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
EEA1Q15075 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
EEA1Q15075 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
EEA1Q15075 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.33
EEA1Q15075 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.33
EEA1Q15075 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
EEA1Q15075 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
EEA1Q15075 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
EEA1Q15075 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
EEA1Q15075 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
EEA1Q15075 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
EEA1Q15075 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
EEA1Q15075 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
EEA1Q15075 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
EEA1Q15075 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC29.63■■■□□ 2.33
EEA1Q15075 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
EEA1Q15075 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
EEA1Q15075 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
EEA1Q15075 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
EEA1Q15075 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
EEA1Q15075 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
EEA1Q15075 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
EEA1Q15075 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
EEA1Q15075 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
EEA1Q15075 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
EEA1Q15075 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
EEA1Q15075 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
EEA1Q15075 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
EEA1Q15075 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
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