Protein–RNA interactions for Protein: Q15025

TNIP1, TNFAIP3-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 636 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNIP1Q15025 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TNIP1Q15025 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TNIP1Q15025 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TNIP1Q15025 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TNIP1Q15025 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TNIP1Q15025 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TNIP1Q15025 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TNIP1Q15025 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TNIP1Q15025 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TNIP1Q15025 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TNIP1Q15025 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
TNIP1Q15025 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
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TNIP1Q15025 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
TNIP1Q15025 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TNIP1Q15025 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
TNIP1Q15025 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
TNIP1Q15025 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TNIP1Q15025 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
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TNIP1Q15025 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TNIP1Q15025 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TNIP1Q15025 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TNIP1Q15025 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
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TNIP1Q15025 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TNIP1Q15025 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TNIP1Q15025 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TNIP1Q15025 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TNIP1Q15025 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TNIP1Q15025 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TNIP1Q15025 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TNIP1Q15025 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TNIP1Q15025 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TNIP1Q15025 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TNIP1Q15025 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
TNIP1Q15025 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TNIP1Q15025 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TNIP1Q15025 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
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TNIP1Q15025 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.1
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TNIP1Q15025 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TNIP1Q15025 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
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TNIP1Q15025 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
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TNIP1Q15025 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
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TNIP1Q15025 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TNIP1Q15025 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TNIP1Q15025 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
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TNIP1Q15025 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
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TNIP1Q15025 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TNIP1Q15025 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TNIP1Q15025 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TNIP1Q15025 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TNIP1Q15025 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TNIP1Q15025 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
TNIP1Q15025 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TNIP1Q15025 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TNIP1Q15025 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TNIP1Q15025 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TNIP1Q15025 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TNIP1Q15025 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TNIP1Q15025 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TNIP1Q15025 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TNIP1Q15025 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TNIP1Q15025 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TNIP1Q15025 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TNIP1Q15025 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TNIP1Q15025 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TNIP1Q15025 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TNIP1Q15025 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
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