Protein–RNA interactions for Protein: Q15012

LAPTM4A, Lysosomal-associated transmembrane protein 4A, humanhuman

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Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAPTM4AQ15012 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
LAPTM4AQ15012 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
LAPTM4AQ15012 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
LAPTM4AQ15012 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
LAPTM4AQ15012 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
LAPTM4AQ15012 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
LAPTM4AQ15012 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
LAPTM4AQ15012 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
LAPTM4AQ15012 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
LAPTM4AQ15012 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
LAPTM4AQ15012 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
LAPTM4AQ15012 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
LAPTM4AQ15012 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
LAPTM4AQ15012 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
LAPTM4AQ15012 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
LAPTM4AQ15012 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
LAPTM4AQ15012 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
LAPTM4AQ15012 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
LAPTM4AQ15012 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
LAPTM4AQ15012 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
LAPTM4AQ15012 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
LAPTM4AQ15012 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
LAPTM4AQ15012 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
LAPTM4AQ15012 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
LAPTM4AQ15012 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
LAPTM4AQ15012 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
LAPTM4AQ15012 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
LAPTM4AQ15012 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
LAPTM4AQ15012 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
LAPTM4AQ15012 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
LAPTM4AQ15012 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
LAPTM4AQ15012 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
LAPTM4AQ15012 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
LAPTM4AQ15012 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
LAPTM4AQ15012 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
LAPTM4AQ15012 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
LAPTM4AQ15012 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
LAPTM4AQ15012 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
LAPTM4AQ15012 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
LAPTM4AQ15012 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
LAPTM4AQ15012 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
LAPTM4AQ15012 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
LAPTM4AQ15012 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
LAPTM4AQ15012 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
LAPTM4AQ15012 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
LAPTM4AQ15012 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
LAPTM4AQ15012 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
LAPTM4AQ15012 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
LAPTM4AQ15012 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
LAPTM4AQ15012 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
LAPTM4AQ15012 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
LAPTM4AQ15012 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
LAPTM4AQ15012 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
LAPTM4AQ15012 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
LAPTM4AQ15012 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
LAPTM4AQ15012 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
LAPTM4AQ15012 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
LAPTM4AQ15012 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
LAPTM4AQ15012 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
LAPTM4AQ15012 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
LAPTM4AQ15012 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
LAPTM4AQ15012 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
LAPTM4AQ15012 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
LAPTM4AQ15012 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
LAPTM4AQ15012 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
LAPTM4AQ15012 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
LAPTM4AQ15012 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
LAPTM4AQ15012 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
LAPTM4AQ15012 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
LAPTM4AQ15012 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
LAPTM4AQ15012 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
LAPTM4AQ15012 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC17.04■□□□□ 0.32
LAPTM4AQ15012 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
LAPTM4AQ15012 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
LAPTM4AQ15012 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
LAPTM4AQ15012 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
LAPTM4AQ15012 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
LAPTM4AQ15012 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
LAPTM4AQ15012 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
LAPTM4AQ15012 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
LAPTM4AQ15012 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
LAPTM4AQ15012 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
LAPTM4AQ15012 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
LAPTM4AQ15012 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
LAPTM4AQ15012 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LAPTM4AQ15012 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LAPTM4AQ15012 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LAPTM4AQ15012 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LAPTM4AQ15012 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
LAPTM4AQ15012 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
LAPTM4AQ15012 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
LAPTM4AQ15012 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
LAPTM4AQ15012 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LAPTM4AQ15012 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
LAPTM4AQ15012 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LAPTM4AQ15012 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
LAPTM4AQ15012 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LAPTM4AQ15012 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LAPTM4AQ15012 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
LAPTM4AQ15012 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
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