Protein–RNA interactions for Protein: Q15003

NCAPH, Condensin complex subunit 2, humanhuman

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Length 741 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPHQ15003 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NCAPHQ15003 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NCAPHQ15003 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NCAPHQ15003 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NCAPHQ15003 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NCAPHQ15003 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NCAPHQ15003 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NCAPHQ15003 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NCAPHQ15003 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NCAPHQ15003 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NCAPHQ15003 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NCAPHQ15003 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NCAPHQ15003 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NCAPHQ15003 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
NCAPHQ15003 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
NCAPHQ15003 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
NCAPHQ15003 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NCAPHQ15003 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NCAPHQ15003 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NCAPHQ15003 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NCAPHQ15003 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NCAPHQ15003 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NCAPHQ15003 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NCAPHQ15003 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NCAPHQ15003 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NCAPHQ15003 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NCAPHQ15003 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NCAPHQ15003 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NCAPHQ15003 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NCAPHQ15003 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NCAPHQ15003 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NCAPHQ15003 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NCAPHQ15003 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NCAPHQ15003 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NCAPHQ15003 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NCAPHQ15003 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NCAPHQ15003 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NCAPHQ15003 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NCAPHQ15003 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NCAPHQ15003 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NCAPHQ15003 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NCAPHQ15003 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NCAPHQ15003 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NCAPHQ15003 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NCAPHQ15003 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NCAPHQ15003 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NCAPHQ15003 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NCAPHQ15003 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NCAPHQ15003 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NCAPHQ15003 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NCAPHQ15003 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NCAPHQ15003 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NCAPHQ15003 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NCAPHQ15003 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NCAPHQ15003 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NCAPHQ15003 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NCAPHQ15003 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NCAPHQ15003 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NCAPHQ15003 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NCAPHQ15003 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NCAPHQ15003 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
NCAPHQ15003 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NCAPHQ15003 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
NCAPHQ15003 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NCAPHQ15003 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NCAPHQ15003 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NCAPHQ15003 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NCAPHQ15003 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NCAPHQ15003 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NCAPHQ15003 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NCAPHQ15003 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NCAPHQ15003 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NCAPHQ15003 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NCAPHQ15003 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NCAPHQ15003 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NCAPHQ15003 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NCAPHQ15003 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NCAPHQ15003 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NCAPHQ15003 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
NCAPHQ15003 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NCAPHQ15003 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NCAPHQ15003 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NCAPHQ15003 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NCAPHQ15003 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NCAPHQ15003 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NCAPHQ15003 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NCAPHQ15003 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NCAPHQ15003 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NCAPHQ15003 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NCAPHQ15003 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NCAPHQ15003 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NCAPHQ15003 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NCAPHQ15003 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
NCAPHQ15003 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NCAPHQ15003 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NCAPHQ15003 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NCAPHQ15003 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NCAPHQ15003 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NCAPHQ15003 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
NCAPHQ15003 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
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