Protein–RNA interactions for Protein: Q14699

RFTN1, Raftlin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 578 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN1Q14699 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RFTN1Q14699 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RFTN1Q14699 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RFTN1Q14699 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RFTN1Q14699 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RFTN1Q14699 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RFTN1Q14699 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
RFTN1Q14699 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RFTN1Q14699 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RFTN1Q14699 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RFTN1Q14699 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RFTN1Q14699 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RFTN1Q14699 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RFTN1Q14699 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RFTN1Q14699 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RFTN1Q14699 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RFTN1Q14699 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RFTN1Q14699 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
RFTN1Q14699 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
RFTN1Q14699 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RFTN1Q14699 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RFTN1Q14699 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RFTN1Q14699 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RFTN1Q14699 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RFTN1Q14699 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RFTN1Q14699 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RFTN1Q14699 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RFTN1Q14699 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RFTN1Q14699 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RFTN1Q14699 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RFTN1Q14699 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RFTN1Q14699 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RFTN1Q14699 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RFTN1Q14699 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RFTN1Q14699 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
RFTN1Q14699 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RFTN1Q14699 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
RFTN1Q14699 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
RFTN1Q14699 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
RFTN1Q14699 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
RFTN1Q14699 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
RFTN1Q14699 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
RFTN1Q14699 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
RFTN1Q14699 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
RFTN1Q14699 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
RFTN1Q14699 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.57
RFTN1Q14699 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
RFTN1Q14699 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RFTN1Q14699 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RFTN1Q14699 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RFTN1Q14699 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RFTN1Q14699 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RFTN1Q14699 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
RFTN1Q14699 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RFTN1Q14699 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RFTN1Q14699 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RFTN1Q14699 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RFTN1Q14699 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RFTN1Q14699 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RFTN1Q14699 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RFTN1Q14699 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RFTN1Q14699 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RFTN1Q14699 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RFTN1Q14699 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RFTN1Q14699 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RFTN1Q14699 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RFTN1Q14699 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RFTN1Q14699 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RFTN1Q14699 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RFTN1Q14699 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RFTN1Q14699 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
RFTN1Q14699 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RFTN1Q14699 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
RFTN1Q14699 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RFTN1Q14699 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RFTN1Q14699 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
RFTN1Q14699 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RFTN1Q14699 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RFTN1Q14699 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RFTN1Q14699 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RFTN1Q14699 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RFTN1Q14699 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
RFTN1Q14699 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RFTN1Q14699 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RFTN1Q14699 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RFTN1Q14699 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RFTN1Q14699 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RFTN1Q14699 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RFTN1Q14699 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RFTN1Q14699 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RFTN1Q14699 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RFTN1Q14699 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RFTN1Q14699 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RFTN1Q14699 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RFTN1Q14699 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RFTN1Q14699 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RFTN1Q14699 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RFTN1Q14699 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RFTN1Q14699 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RFTN1Q14699 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
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