Protein–RNA interactions for Protein: Q14574

DSC3, Desmocollin-3, humanhuman

Predictions only

Length 896 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSC3Q14574 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
DSC3Q14574 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
DSC3Q14574 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
DSC3Q14574 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
DSC3Q14574 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
DSC3Q14574 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
DSC3Q14574 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
DSC3Q14574 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
DSC3Q14574 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
DSC3Q14574 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
DSC3Q14574 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
DSC3Q14574 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
DSC3Q14574 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
DSC3Q14574 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
DSC3Q14574 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
DSC3Q14574 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
DSC3Q14574 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
DSC3Q14574 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
DSC3Q14574 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
DSC3Q14574 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
DSC3Q14574 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
DSC3Q14574 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
DSC3Q14574 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
DSC3Q14574 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
DSC3Q14574 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
DSC3Q14574 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
DSC3Q14574 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
DSC3Q14574 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC19.64■□□□□ 0.74
DSC3Q14574 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
DSC3Q14574 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC19.64■□□□□ 0.73
DSC3Q14574 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
DSC3Q14574 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
DSC3Q14574 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
DSC3Q14574 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
DSC3Q14574 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
DSC3Q14574 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
DSC3Q14574 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
DSC3Q14574 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC19.64■□□□□ 0.73
DSC3Q14574 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC19.64■□□□□ 0.73
DSC3Q14574 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
DSC3Q14574 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC19.64■□□□□ 0.73
DSC3Q14574 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
DSC3Q14574 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
DSC3Q14574 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
DSC3Q14574 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
DSC3Q14574 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
DSC3Q14574 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
DSC3Q14574 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
DSC3Q14574 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
DSC3Q14574 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
DSC3Q14574 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
DSC3Q14574 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
DSC3Q14574 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
DSC3Q14574 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC19.63■□□□□ 0.73
DSC3Q14574 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
DSC3Q14574 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC19.63■□□□□ 0.73
DSC3Q14574 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
DSC3Q14574 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
DSC3Q14574 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
DSC3Q14574 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
DSC3Q14574 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
DSC3Q14574 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
DSC3Q14574 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
DSC3Q14574 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
DSC3Q14574 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
DSC3Q14574 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
DSC3Q14574 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
DSC3Q14574 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
DSC3Q14574 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
DSC3Q14574 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
DSC3Q14574 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
DSC3Q14574 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
DSC3Q14574 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
DSC3Q14574 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
DSC3Q14574 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
DSC3Q14574 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
DSC3Q14574 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
DSC3Q14574 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
DSC3Q14574 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
DSC3Q14574 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
DSC3Q14574 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
DSC3Q14574 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
DSC3Q14574 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
DSC3Q14574 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
DSC3Q14574 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
DSC3Q14574 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
DSC3Q14574 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
DSC3Q14574 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
DSC3Q14574 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
DSC3Q14574 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
DSC3Q14574 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
DSC3Q14574 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
DSC3Q14574 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
DSC3Q14574 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
DSC3Q14574 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
DSC3Q14574 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
DSC3Q14574 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC19.62■□□□□ 0.73
DSC3Q14574 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
DSC3Q14574 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
DSC3Q14574 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms