Protein–RNA interactions for Protein: Q14525

KRT33B, Keratin, type I cuticular Ha3-II, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT33BQ14525 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
KRT33BQ14525 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
KRT33BQ14525 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
KRT33BQ14525 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
KRT33BQ14525 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
KRT33BQ14525 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
KRT33BQ14525 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
KRT33BQ14525 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
KRT33BQ14525 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
KRT33BQ14525 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
KRT33BQ14525 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
KRT33BQ14525 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
KRT33BQ14525 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
KRT33BQ14525 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
KRT33BQ14525 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
KRT33BQ14525 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
KRT33BQ14525 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
KRT33BQ14525 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
KRT33BQ14525 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
KRT33BQ14525 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
KRT33BQ14525 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
KRT33BQ14525 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
KRT33BQ14525 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
KRT33BQ14525 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
KRT33BQ14525 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
KRT33BQ14525 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
KRT33BQ14525 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
KRT33BQ14525 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
KRT33BQ14525 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
KRT33BQ14525 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
KRT33BQ14525 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
KRT33BQ14525 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
KRT33BQ14525 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
KRT33BQ14525 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
KRT33BQ14525 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
KRT33BQ14525 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
KRT33BQ14525 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
KRT33BQ14525 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
KRT33BQ14525 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
KRT33BQ14525 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
KRT33BQ14525 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
KRT33BQ14525 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
KRT33BQ14525 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
KRT33BQ14525 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
KRT33BQ14525 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
KRT33BQ14525 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
KRT33BQ14525 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
KRT33BQ14525 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
KRT33BQ14525 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
KRT33BQ14525 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
KRT33BQ14525 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
KRT33BQ14525 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
KRT33BQ14525 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
KRT33BQ14525 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
KRT33BQ14525 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
KRT33BQ14525 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
KRT33BQ14525 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
KRT33BQ14525 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
KRT33BQ14525 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
KRT33BQ14525 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
KRT33BQ14525 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
KRT33BQ14525 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
KRT33BQ14525 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
KRT33BQ14525 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
KRT33BQ14525 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
KRT33BQ14525 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
KRT33BQ14525 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
KRT33BQ14525 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
KRT33BQ14525 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
KRT33BQ14525 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
KRT33BQ14525 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
KRT33BQ14525 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
KRT33BQ14525 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
KRT33BQ14525 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
KRT33BQ14525 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
KRT33BQ14525 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
KRT33BQ14525 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
KRT33BQ14525 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
KRT33BQ14525 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
KRT33BQ14525 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
KRT33BQ14525 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
KRT33BQ14525 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
KRT33BQ14525 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
KRT33BQ14525 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
KRT33BQ14525 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
KRT33BQ14525 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
KRT33BQ14525 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
KRT33BQ14525 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
KRT33BQ14525 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
KRT33BQ14525 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
KRT33BQ14525 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
KRT33BQ14525 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
KRT33BQ14525 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
KRT33BQ14525 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
KRT33BQ14525 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
KRT33BQ14525 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
KRT33BQ14525 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
KRT33BQ14525 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
KRT33BQ14525 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
KRT33BQ14525 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms