Protein–RNA interactions for Protein: Q14008

CKAP5, Cytoskeleton-associated protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 2,032 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP5Q14008 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CKAP5Q14008 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CKAP5Q14008 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CKAP5Q14008 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CKAP5Q14008 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CKAP5Q14008 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CKAP5Q14008 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CKAP5Q14008 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CKAP5Q14008 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CKAP5Q14008 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CKAP5Q14008 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CKAP5Q14008 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CKAP5Q14008 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CKAP5Q14008 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CKAP5Q14008 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CKAP5Q14008 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CKAP5Q14008 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CKAP5Q14008 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CKAP5Q14008 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CKAP5Q14008 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CKAP5Q14008 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CKAP5Q14008 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CKAP5Q14008 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CKAP5Q14008 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CKAP5Q14008 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CKAP5Q14008 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CKAP5Q14008 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CKAP5Q14008 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CKAP5Q14008 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CKAP5Q14008 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CKAP5Q14008 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CKAP5Q14008 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CKAP5Q14008 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CKAP5Q14008 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CKAP5Q14008 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CKAP5Q14008 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CKAP5Q14008 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CKAP5Q14008 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CKAP5Q14008 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CKAP5Q14008 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CKAP5Q14008 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CKAP5Q14008 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CKAP5Q14008 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CKAP5Q14008 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CKAP5Q14008 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CKAP5Q14008 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CKAP5Q14008 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CKAP5Q14008 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CKAP5Q14008 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CKAP5Q14008 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CKAP5Q14008 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CKAP5Q14008 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CKAP5Q14008 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CKAP5Q14008 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CKAP5Q14008 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CKAP5Q14008 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CKAP5Q14008 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CKAP5Q14008 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CKAP5Q14008 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CKAP5Q14008 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CKAP5Q14008 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CKAP5Q14008 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CKAP5Q14008 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CKAP5Q14008 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CKAP5Q14008 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CKAP5Q14008 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CKAP5Q14008 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CKAP5Q14008 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CKAP5Q14008 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CKAP5Q14008 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CKAP5Q14008 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CKAP5Q14008 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CKAP5Q14008 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
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CKAP5Q14008 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CKAP5Q14008 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CKAP5Q14008 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CKAP5Q14008 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CKAP5Q14008 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CKAP5Q14008 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CKAP5Q14008 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CKAP5Q14008 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CKAP5Q14008 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CKAP5Q14008 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CKAP5Q14008 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CKAP5Q14008 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CKAP5Q14008 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CKAP5Q14008 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CKAP5Q14008 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CKAP5Q14008 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CKAP5Q14008 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CKAP5Q14008 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CKAP5Q14008 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CKAP5Q14008 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CKAP5Q14008 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CKAP5Q14008 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CKAP5Q14008 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CKAP5Q14008 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CKAP5Q14008 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CKAP5Q14008 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
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