Protein–RNA interactions for Protein: Q13616

CUL1, Cullin-1, humanhuman

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Length 776 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL1Q13616 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CUL1Q13616 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CUL1Q13616 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CUL1Q13616 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CUL1Q13616 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CUL1Q13616 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CUL1Q13616 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CUL1Q13616 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CUL1Q13616 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CUL1Q13616 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CUL1Q13616 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CUL1Q13616 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CUL1Q13616 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CUL1Q13616 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
CUL1Q13616 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CUL1Q13616 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CUL1Q13616 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CUL1Q13616 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CUL1Q13616 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CUL1Q13616 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CUL1Q13616 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CUL1Q13616 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CUL1Q13616 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CUL1Q13616 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CUL1Q13616 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
CUL1Q13616 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CUL1Q13616 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CUL1Q13616 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CUL1Q13616 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CUL1Q13616 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CUL1Q13616 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CUL1Q13616 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CUL1Q13616 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CUL1Q13616 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CUL1Q13616 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CUL1Q13616 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CUL1Q13616 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CUL1Q13616 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CUL1Q13616 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CUL1Q13616 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
CUL1Q13616 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CUL1Q13616 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CUL1Q13616 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CUL1Q13616 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CUL1Q13616 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CUL1Q13616 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CUL1Q13616 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CUL1Q13616 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CUL1Q13616 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CUL1Q13616 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CUL1Q13616 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CUL1Q13616 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CUL1Q13616 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CUL1Q13616 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CUL1Q13616 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CUL1Q13616 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CUL1Q13616 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CUL1Q13616 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CUL1Q13616 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CUL1Q13616 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CUL1Q13616 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
CUL1Q13616 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CUL1Q13616 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CUL1Q13616 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CUL1Q13616 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CUL1Q13616 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CUL1Q13616 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CUL1Q13616 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CUL1Q13616 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CUL1Q13616 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CUL1Q13616 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CUL1Q13616 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CUL1Q13616 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CUL1Q13616 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CUL1Q13616 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CUL1Q13616 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CUL1Q13616 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CUL1Q13616 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CUL1Q13616 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CUL1Q13616 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
CUL1Q13616 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CUL1Q13616 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CUL1Q13616 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CUL1Q13616 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CUL1Q13616 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
CUL1Q13616 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CUL1Q13616 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CUL1Q13616 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CUL1Q13616 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CUL1Q13616 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
CUL1Q13616 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CUL1Q13616 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CUL1Q13616 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CUL1Q13616 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CUL1Q13616 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CUL1Q13616 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CUL1Q13616 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CUL1Q13616 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CUL1Q13616 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CUL1Q13616 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
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