Protein–RNA interactions for Protein: Q13536

C1orf61, Protein CROC-4, humanhuman

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Length 156 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf61Q13536 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
C1orf61Q13536 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
C1orf61Q13536 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
C1orf61Q13536 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
C1orf61Q13536 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
C1orf61Q13536 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
C1orf61Q13536 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
C1orf61Q13536 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
C1orf61Q13536 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
C1orf61Q13536 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
C1orf61Q13536 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
C1orf61Q13536 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
C1orf61Q13536 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
C1orf61Q13536 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
C1orf61Q13536 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
C1orf61Q13536 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
C1orf61Q13536 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
C1orf61Q13536 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
C1orf61Q13536 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
C1orf61Q13536 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
C1orf61Q13536 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
C1orf61Q13536 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
C1orf61Q13536 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
C1orf61Q13536 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
C1orf61Q13536 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
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C1orf61Q13536 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
C1orf61Q13536 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
C1orf61Q13536 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
C1orf61Q13536 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
C1orf61Q13536 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
C1orf61Q13536 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
C1orf61Q13536 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
C1orf61Q13536 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
C1orf61Q13536 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
C1orf61Q13536 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
C1orf61Q13536 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
C1orf61Q13536 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
C1orf61Q13536 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
C1orf61Q13536 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
C1orf61Q13536 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
C1orf61Q13536 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
C1orf61Q13536 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
C1orf61Q13536 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
C1orf61Q13536 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
C1orf61Q13536 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
C1orf61Q13536 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
C1orf61Q13536 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
C1orf61Q13536 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
C1orf61Q13536 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
C1orf61Q13536 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
C1orf61Q13536 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
C1orf61Q13536 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
C1orf61Q13536 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
C1orf61Q13536 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
C1orf61Q13536 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
C1orf61Q13536 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
C1orf61Q13536 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
C1orf61Q13536 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
C1orf61Q13536 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
C1orf61Q13536 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
C1orf61Q13536 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
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C1orf61Q13536 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
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C1orf61Q13536 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
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C1orf61Q13536 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
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C1orf61Q13536 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
C1orf61Q13536 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
C1orf61Q13536 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
C1orf61Q13536 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
C1orf61Q13536 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
C1orf61Q13536 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
C1orf61Q13536 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
C1orf61Q13536 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
C1orf61Q13536 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
C1orf61Q13536 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
C1orf61Q13536 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
C1orf61Q13536 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
C1orf61Q13536 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
C1orf61Q13536 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
C1orf61Q13536 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
C1orf61Q13536 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
C1orf61Q13536 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
C1orf61Q13536 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
C1orf61Q13536 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
C1orf61Q13536 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
C1orf61Q13536 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
C1orf61Q13536 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
C1orf61Q13536 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
C1orf61Q13536 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
C1orf61Q13536 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
C1orf61Q13536 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
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