Protein–RNA interactions for Protein: Q13461

FOXE3, Forkhead box protein E3, humanhuman

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Length 319 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXE3Q13461 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
FOXE3Q13461 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
FOXE3Q13461 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
FOXE3Q13461 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
FOXE3Q13461 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
FOXE3Q13461 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
FOXE3Q13461 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
FOXE3Q13461 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC14.42□□□□□ -0.1
FOXE3Q13461 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
FOXE3Q13461 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
FOXE3Q13461 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
FOXE3Q13461 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC14.42□□□□□ -0.1
FOXE3Q13461 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
FOXE3Q13461 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
FOXE3Q13461 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
FOXE3Q13461 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
FOXE3Q13461 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
FOXE3Q13461 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
FOXE3Q13461 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
FOXE3Q13461 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
FOXE3Q13461 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
FOXE3Q13461 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
FOXE3Q13461 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
FOXE3Q13461 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
FOXE3Q13461 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
FOXE3Q13461 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
FOXE3Q13461 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
FOXE3Q13461 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
FOXE3Q13461 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
FOXE3Q13461 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
FOXE3Q13461 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
FOXE3Q13461 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
FOXE3Q13461 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
FOXE3Q13461 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
FOXE3Q13461 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
FOXE3Q13461 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
FOXE3Q13461 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
FOXE3Q13461 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
FOXE3Q13461 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
FOXE3Q13461 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
FOXE3Q13461 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
FOXE3Q13461 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC14.41□□□□□ -0.1
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FOXE3Q13461 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
FOXE3Q13461 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
FOXE3Q13461 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
FOXE3Q13461 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
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FOXE3Q13461 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
FOXE3Q13461 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
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FOXE3Q13461 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
FOXE3Q13461 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
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FOXE3Q13461 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
FOXE3Q13461 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
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FOXE3Q13461 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
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FOXE3Q13461 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
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FOXE3Q13461 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
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FOXE3Q13461 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
FOXE3Q13461 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
FOXE3Q13461 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
FOXE3Q13461 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
FOXE3Q13461 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
FOXE3Q13461 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
FOXE3Q13461 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
FOXE3Q13461 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
FOXE3Q13461 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
FOXE3Q13461 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
FOXE3Q13461 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
FOXE3Q13461 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
FOXE3Q13461 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
FOXE3Q13461 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
FOXE3Q13461 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
FOXE3Q13461 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
FOXE3Q13461 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
FOXE3Q13461 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
FOXE3Q13461 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
FOXE3Q13461 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
FOXE3Q13461 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
FOXE3Q13461 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
FOXE3Q13461 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
FOXE3Q13461 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
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