Protein–RNA interactions for Protein: Q13370

PDE3B, cGMP-inhibited 3',5'-cyclic phosphodiesterase B, humanhuman

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Length 1,112 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE3BQ13370 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PDE3BQ13370 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PDE3BQ13370 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PDE3BQ13370 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PDE3BQ13370 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PDE3BQ13370 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PDE3BQ13370 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PDE3BQ13370 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PDE3BQ13370 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
PDE3BQ13370 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PDE3BQ13370 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PDE3BQ13370 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PDE3BQ13370 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PDE3BQ13370 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PDE3BQ13370 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PDE3BQ13370 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
PDE3BQ13370 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
PDE3BQ13370 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
PDE3BQ13370 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PDE3BQ13370 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PDE3BQ13370 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PDE3BQ13370 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PDE3BQ13370 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PDE3BQ13370 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PDE3BQ13370 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PDE3BQ13370 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PDE3BQ13370 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PDE3BQ13370 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PDE3BQ13370 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PDE3BQ13370 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PDE3BQ13370 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PDE3BQ13370 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PDE3BQ13370 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PDE3BQ13370 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PDE3BQ13370 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PDE3BQ13370 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
PDE3BQ13370 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PDE3BQ13370 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
PDE3BQ13370 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PDE3BQ13370 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PDE3BQ13370 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PDE3BQ13370 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PDE3BQ13370 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PDE3BQ13370 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
PDE3BQ13370 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PDE3BQ13370 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PDE3BQ13370 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PDE3BQ13370 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PDE3BQ13370 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
PDE3BQ13370 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PDE3BQ13370 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PDE3BQ13370 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PDE3BQ13370 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PDE3BQ13370 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
PDE3BQ13370 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PDE3BQ13370 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PDE3BQ13370 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PDE3BQ13370 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PDE3BQ13370 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PDE3BQ13370 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
PDE3BQ13370 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
PDE3BQ13370 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PDE3BQ13370 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PDE3BQ13370 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PDE3BQ13370 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PDE3BQ13370 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PDE3BQ13370 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PDE3BQ13370 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PDE3BQ13370 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PDE3BQ13370 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PDE3BQ13370 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PDE3BQ13370 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PDE3BQ13370 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PDE3BQ13370 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PDE3BQ13370 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PDE3BQ13370 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PDE3BQ13370 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PDE3BQ13370 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PDE3BQ13370 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PDE3BQ13370 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PDE3BQ13370 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PDE3BQ13370 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PDE3BQ13370 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PDE3BQ13370 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PDE3BQ13370 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PDE3BQ13370 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PDE3BQ13370 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PDE3BQ13370 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PDE3BQ13370 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
PDE3BQ13370 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PDE3BQ13370 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PDE3BQ13370 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PDE3BQ13370 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PDE3BQ13370 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
PDE3BQ13370 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PDE3BQ13370 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PDE3BQ13370 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PDE3BQ13370 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PDE3BQ13370 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PDE3BQ13370 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
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