Protein–RNA interactions for Protein: Q13352

ITGB3BP, Centromere protein R, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 177 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3BPQ13352 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ITGB3BPQ13352 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ITGB3BPQ13352 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ITGB3BPQ13352 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ITGB3BPQ13352 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ITGB3BPQ13352 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ITGB3BPQ13352 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ITGB3BPQ13352 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ITGB3BPQ13352 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ITGB3BPQ13352 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ITGB3BPQ13352 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ITGB3BPQ13352 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ITGB3BPQ13352 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ITGB3BPQ13352 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ITGB3BPQ13352 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ITGB3BPQ13352 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ITGB3BPQ13352 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ITGB3BPQ13352 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ITGB3BPQ13352 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
ITGB3BPQ13352 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ITGB3BPQ13352 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ITGB3BPQ13352 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ITGB3BPQ13352 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ITGB3BPQ13352 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ITGB3BPQ13352 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ITGB3BPQ13352 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ITGB3BPQ13352 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ITGB3BPQ13352 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ITGB3BPQ13352 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ITGB3BPQ13352 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ITGB3BPQ13352 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ITGB3BPQ13352 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
ITGB3BPQ13352 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ITGB3BPQ13352 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ITGB3BPQ13352 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ITGB3BPQ13352 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ITGB3BPQ13352 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ITGB3BPQ13352 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ITGB3BPQ13352 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ITGB3BPQ13352 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ITGB3BPQ13352 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ITGB3BPQ13352 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ITGB3BPQ13352 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ITGB3BPQ13352 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ITGB3BPQ13352 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ITGB3BPQ13352 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ITGB3BPQ13352 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
ITGB3BPQ13352 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
ITGB3BPQ13352 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ITGB3BPQ13352 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ITGB3BPQ13352 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
ITGB3BPQ13352 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
ITGB3BPQ13352 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ITGB3BPQ13352 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ITGB3BPQ13352 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ITGB3BPQ13352 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ITGB3BPQ13352 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ITGB3BPQ13352 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ITGB3BPQ13352 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ITGB3BPQ13352 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ITGB3BPQ13352 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ITGB3BPQ13352 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ITGB3BPQ13352 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ITGB3BPQ13352 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ITGB3BPQ13352 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ITGB3BPQ13352 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ITGB3BPQ13352 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ITGB3BPQ13352 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ITGB3BPQ13352 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
ITGB3BPQ13352 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ITGB3BPQ13352 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ITGB3BPQ13352 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ITGB3BPQ13352 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ITGB3BPQ13352 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ITGB3BPQ13352 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ITGB3BPQ13352 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ITGB3BPQ13352 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ITGB3BPQ13352 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ITGB3BPQ13352 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ITGB3BPQ13352 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ITGB3BPQ13352 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ITGB3BPQ13352 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
ITGB3BPQ13352 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ITGB3BPQ13352 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ITGB3BPQ13352 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ITGB3BPQ13352 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ITGB3BPQ13352 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ITGB3BPQ13352 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ITGB3BPQ13352 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ITGB3BPQ13352 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ITGB3BPQ13352 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ITGB3BPQ13352 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ITGB3BPQ13352 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ITGB3BPQ13352 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ITGB3BPQ13352 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ITGB3BPQ13352 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ITGB3BPQ13352 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ITGB3BPQ13352 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
ITGB3BPQ13352 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ITGB3BPQ13352 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
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