Protein–RNA interactions for Protein: Q13286

CLN3, Battenin, humanhuman

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3Q13286 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CLN3Q13286 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CLN3Q13286 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CLN3Q13286 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CLN3Q13286 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CLN3Q13286 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CLN3Q13286 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CLN3Q13286 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CLN3Q13286 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CLN3Q13286 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CLN3Q13286 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CLN3Q13286 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CLN3Q13286 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CLN3Q13286 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CLN3Q13286 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CLN3Q13286 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CLN3Q13286 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CLN3Q13286 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CLN3Q13286 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CLN3Q13286 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CLN3Q13286 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CLN3Q13286 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CLN3Q13286 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CLN3Q13286 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CLN3Q13286 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CLN3Q13286 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CLN3Q13286 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CLN3Q13286 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CLN3Q13286 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CLN3Q13286 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CLN3Q13286 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CLN3Q13286 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CLN3Q13286 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CLN3Q13286 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CLN3Q13286 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CLN3Q13286 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CLN3Q13286 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CLN3Q13286 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CLN3Q13286 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CLN3Q13286 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CLN3Q13286 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CLN3Q13286 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CLN3Q13286 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CLN3Q13286 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CLN3Q13286 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CLN3Q13286 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CLN3Q13286 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
CLN3Q13286 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CLN3Q13286 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CLN3Q13286 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CLN3Q13286 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
CLN3Q13286 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
CLN3Q13286 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CLN3Q13286 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CLN3Q13286 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
CLN3Q13286 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CLN3Q13286 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
CLN3Q13286 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CLN3Q13286 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
CLN3Q13286 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
CLN3Q13286 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CLN3Q13286 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CLN3Q13286 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CLN3Q13286 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CLN3Q13286 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CLN3Q13286 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CLN3Q13286 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CLN3Q13286 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CLN3Q13286 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CLN3Q13286 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CLN3Q13286 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CLN3Q13286 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CLN3Q13286 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CLN3Q13286 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CLN3Q13286 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CLN3Q13286 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CLN3Q13286 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CLN3Q13286 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CLN3Q13286 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CLN3Q13286 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CLN3Q13286 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CLN3Q13286 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CLN3Q13286 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CLN3Q13286 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CLN3Q13286 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CLN3Q13286 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
CLN3Q13286 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CLN3Q13286 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
CLN3Q13286 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CLN3Q13286 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CLN3Q13286 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
CLN3Q13286 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CLN3Q13286 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CLN3Q13286 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CLN3Q13286 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CLN3Q13286 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CLN3Q13286 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CLN3Q13286 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CLN3Q13286 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CLN3Q13286 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
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