Protein–RNA interactions for Protein: Q13247

SRSF6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF6Q13247 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SRSF6Q13247 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SRSF6Q13247 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
SRSF6Q13247 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SRSF6Q13247 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SRSF6Q13247 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SRSF6Q13247 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SRSF6Q13247 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SRSF6Q13247 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SRSF6Q13247 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SRSF6Q13247 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SRSF6Q13247 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SRSF6Q13247 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SRSF6Q13247 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SRSF6Q13247 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SRSF6Q13247 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SRSF6Q13247 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SRSF6Q13247 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SRSF6Q13247 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SRSF6Q13247 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SRSF6Q13247 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SRSF6Q13247 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SRSF6Q13247 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SRSF6Q13247 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SRSF6Q13247 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SRSF6Q13247 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SRSF6Q13247 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SRSF6Q13247 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SRSF6Q13247 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SRSF6Q13247 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SRSF6Q13247 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SRSF6Q13247 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SRSF6Q13247 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SRSF6Q13247 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SRSF6Q13247 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SRSF6Q13247 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SRSF6Q13247 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SRSF6Q13247 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SRSF6Q13247 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SRSF6Q13247 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SRSF6Q13247 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SRSF6Q13247 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SRSF6Q13247 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SRSF6Q13247 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SRSF6Q13247 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SRSF6Q13247 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SRSF6Q13247 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
SRSF6Q13247 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SRSF6Q13247 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
SRSF6Q13247 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
SRSF6Q13247 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SRSF6Q13247 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
SRSF6Q13247 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SRSF6Q13247 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SRSF6Q13247 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SRSF6Q13247 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
SRSF6Q13247 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SRSF6Q13247 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SRSF6Q13247 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SRSF6Q13247 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SRSF6Q13247 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SRSF6Q13247 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SRSF6Q13247 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SRSF6Q13247 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
SRSF6Q13247 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SRSF6Q13247 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
SRSF6Q13247 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SRSF6Q13247 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SRSF6Q13247 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SRSF6Q13247 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SRSF6Q13247 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SRSF6Q13247 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SRSF6Q13247 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SRSF6Q13247 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SRSF6Q13247 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SRSF6Q13247 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SRSF6Q13247 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SRSF6Q13247 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SRSF6Q13247 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SRSF6Q13247 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
SRSF6Q13247 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SRSF6Q13247 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SRSF6Q13247 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SRSF6Q13247 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SRSF6Q13247 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SRSF6Q13247 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
SRSF6Q13247 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
SRSF6Q13247 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
SRSF6Q13247 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SRSF6Q13247 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SRSF6Q13247 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
SRSF6Q13247 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SRSF6Q13247 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SRSF6Q13247 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
SRSF6Q13247 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SRSF6Q13247 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SRSF6Q13247 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SRSF6Q13247 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SRSF6Q13247 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SRSF6Q13247 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms