Protein–RNA interactions for Protein: Q13232

NME3, Nucleoside diphosphate kinase 3, humanhuman

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Length 169 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME3Q13232 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NME3Q13232 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NME3Q13232 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NME3Q13232 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NME3Q13232 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NME3Q13232 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NME3Q13232 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NME3Q13232 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NME3Q13232 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NME3Q13232 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NME3Q13232 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NME3Q13232 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NME3Q13232 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
NME3Q13232 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NME3Q13232 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NME3Q13232 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NME3Q13232 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
NME3Q13232 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NME3Q13232 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
NME3Q13232 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NME3Q13232 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NME3Q13232 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NME3Q13232 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NME3Q13232 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NME3Q13232 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NME3Q13232 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NME3Q13232 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NME3Q13232 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NME3Q13232 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NME3Q13232 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NME3Q13232 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NME3Q13232 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NME3Q13232 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NME3Q13232 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NME3Q13232 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NME3Q13232 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NME3Q13232 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NME3Q13232 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NME3Q13232 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NME3Q13232 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NME3Q13232 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NME3Q13232 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NME3Q13232 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NME3Q13232 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NME3Q13232 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NME3Q13232 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NME3Q13232 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NME3Q13232 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NME3Q13232 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NME3Q13232 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
NME3Q13232 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NME3Q13232 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
NME3Q13232 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
NME3Q13232 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NME3Q13232 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NME3Q13232 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NME3Q13232 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NME3Q13232 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NME3Q13232 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NME3Q13232 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NME3Q13232 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NME3Q13232 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NME3Q13232 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
NME3Q13232 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NME3Q13232 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NME3Q13232 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NME3Q13232 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NME3Q13232 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
NME3Q13232 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NME3Q13232 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NME3Q13232 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NME3Q13232 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
NME3Q13232 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NME3Q13232 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NME3Q13232 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NME3Q13232 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NME3Q13232 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NME3Q13232 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NME3Q13232 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NME3Q13232 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NME3Q13232 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NME3Q13232 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NME3Q13232 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
NME3Q13232 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
NME3Q13232 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NME3Q13232 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NME3Q13232 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
NME3Q13232 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NME3Q13232 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
NME3Q13232 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NME3Q13232 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NME3Q13232 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NME3Q13232 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NME3Q13232 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NME3Q13232 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NME3Q13232 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NME3Q13232 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NME3Q13232 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NME3Q13232 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NME3Q13232 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
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