Protein–RNA interactions for Protein: Q13214

SEMA3B, Semaphorin-3B, humanhuman

Predictions only

Length 749 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3BQ13214 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SEMA3BQ13214 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SEMA3BQ13214 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SEMA3BQ13214 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SEMA3BQ13214 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SEMA3BQ13214 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SEMA3BQ13214 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SEMA3BQ13214 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SEMA3BQ13214 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SEMA3BQ13214 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SEMA3BQ13214 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SEMA3BQ13214 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SEMA3BQ13214 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SEMA3BQ13214 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SEMA3BQ13214 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SEMA3BQ13214 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SEMA3BQ13214 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
SEMA3BQ13214 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SEMA3BQ13214 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SEMA3BQ13214 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SEMA3BQ13214 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SEMA3BQ13214 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SEMA3BQ13214 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SEMA3BQ13214 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SEMA3BQ13214 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SEMA3BQ13214 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SEMA3BQ13214 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
SEMA3BQ13214 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SEMA3BQ13214 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SEMA3BQ13214 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
SEMA3BQ13214 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SEMA3BQ13214 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SEMA3BQ13214 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SEMA3BQ13214 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SEMA3BQ13214 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SEMA3BQ13214 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SEMA3BQ13214 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SEMA3BQ13214 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SEMA3BQ13214 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SEMA3BQ13214 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SEMA3BQ13214 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SEMA3BQ13214 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SEMA3BQ13214 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SEMA3BQ13214 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
SEMA3BQ13214 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SEMA3BQ13214 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SEMA3BQ13214 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SEMA3BQ13214 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SEMA3BQ13214 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SEMA3BQ13214 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SEMA3BQ13214 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SEMA3BQ13214 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SEMA3BQ13214 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
SEMA3BQ13214 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SEMA3BQ13214 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SEMA3BQ13214 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SEMA3BQ13214 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SEMA3BQ13214 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SEMA3BQ13214 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SEMA3BQ13214 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SEMA3BQ13214 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SEMA3BQ13214 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SEMA3BQ13214 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SEMA3BQ13214 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
SEMA3BQ13214 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
SEMA3BQ13214 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
SEMA3BQ13214 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
SEMA3BQ13214 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
SEMA3BQ13214 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
SEMA3BQ13214 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
SEMA3BQ13214 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
SEMA3BQ13214 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
SEMA3BQ13214 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SEMA3BQ13214 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SEMA3BQ13214 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SEMA3BQ13214 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
SEMA3BQ13214 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SEMA3BQ13214 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
SEMA3BQ13214 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SEMA3BQ13214 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SEMA3BQ13214 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SEMA3BQ13214 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SEMA3BQ13214 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SEMA3BQ13214 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SEMA3BQ13214 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SEMA3BQ13214 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SEMA3BQ13214 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
SEMA3BQ13214 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SEMA3BQ13214 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SEMA3BQ13214 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SEMA3BQ13214 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SEMA3BQ13214 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SEMA3BQ13214 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SEMA3BQ13214 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SEMA3BQ13214 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SEMA3BQ13214 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SEMA3BQ13214 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SEMA3BQ13214 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SEMA3BQ13214 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SEMA3BQ13214 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms