Protein–RNA interactions for Protein: Q13099

IFT88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, humanhuman

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT88Q13099 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
IFT88Q13099 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
IFT88Q13099 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
IFT88Q13099 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
IFT88Q13099 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
IFT88Q13099 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
IFT88Q13099 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
IFT88Q13099 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
IFT88Q13099 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
IFT88Q13099 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
IFT88Q13099 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
IFT88Q13099 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
IFT88Q13099 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
IFT88Q13099 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
IFT88Q13099 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
IFT88Q13099 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
IFT88Q13099 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
IFT88Q13099 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
IFT88Q13099 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
IFT88Q13099 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
IFT88Q13099 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
IFT88Q13099 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
IFT88Q13099 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
IFT88Q13099 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
IFT88Q13099 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
IFT88Q13099 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
IFT88Q13099 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
IFT88Q13099 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
IFT88Q13099 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
IFT88Q13099 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
IFT88Q13099 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
IFT88Q13099 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
IFT88Q13099 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
IFT88Q13099 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
IFT88Q13099 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
IFT88Q13099 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
IFT88Q13099 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
IFT88Q13099 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
IFT88Q13099 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
IFT88Q13099 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
IFT88Q13099 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
IFT88Q13099 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
IFT88Q13099 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
IFT88Q13099 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
IFT88Q13099 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
IFT88Q13099 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
IFT88Q13099 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
IFT88Q13099 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
IFT88Q13099 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
IFT88Q13099 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
IFT88Q13099 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
IFT88Q13099 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
IFT88Q13099 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
IFT88Q13099 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
IFT88Q13099 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
IFT88Q13099 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
IFT88Q13099 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
IFT88Q13099 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
IFT88Q13099 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
IFT88Q13099 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
IFT88Q13099 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC18.6■□□□□ 0.57
IFT88Q13099 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
IFT88Q13099 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
IFT88Q13099 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
IFT88Q13099 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
IFT88Q13099 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
IFT88Q13099 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
IFT88Q13099 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
IFT88Q13099 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
IFT88Q13099 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
IFT88Q13099 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
IFT88Q13099 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
IFT88Q13099 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
IFT88Q13099 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
IFT88Q13099 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
IFT88Q13099 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
IFT88Q13099 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
IFT88Q13099 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
IFT88Q13099 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
IFT88Q13099 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
IFT88Q13099 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
IFT88Q13099 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
IFT88Q13099 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
IFT88Q13099 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
IFT88Q13099 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
IFT88Q13099 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
IFT88Q13099 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
IFT88Q13099 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
IFT88Q13099 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
IFT88Q13099 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
IFT88Q13099 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
IFT88Q13099 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
IFT88Q13099 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
IFT88Q13099 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
IFT88Q13099 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
IFT88Q13099 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
IFT88Q13099 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
IFT88Q13099 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
IFT88Q13099 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
IFT88Q13099 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
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