Protein–RNA interactions for Protein: Q08289

CACNB2, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB2Q08289 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CACNB2Q08289 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CACNB2Q08289 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CACNB2Q08289 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CACNB2Q08289 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
CACNB2Q08289 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CACNB2Q08289 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
CACNB2Q08289 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
CACNB2Q08289 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
CACNB2Q08289 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CACNB2Q08289 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CACNB2Q08289 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CACNB2Q08289 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CACNB2Q08289 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CACNB2Q08289 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CACNB2Q08289 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CACNB2Q08289 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CACNB2Q08289 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CACNB2Q08289 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CACNB2Q08289 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CACNB2Q08289 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CACNB2Q08289 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CACNB2Q08289 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
CACNB2Q08289 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CACNB2Q08289 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CACNB2Q08289 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CACNB2Q08289 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CACNB2Q08289 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CACNB2Q08289 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CACNB2Q08289 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CACNB2Q08289 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CACNB2Q08289 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CACNB2Q08289 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CACNB2Q08289 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CACNB2Q08289 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CACNB2Q08289 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CACNB2Q08289 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CACNB2Q08289 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CACNB2Q08289 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CACNB2Q08289 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CACNB2Q08289 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CACNB2Q08289 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CACNB2Q08289 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CACNB2Q08289 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CACNB2Q08289 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CACNB2Q08289 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
CACNB2Q08289 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CACNB2Q08289 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CACNB2Q08289 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CACNB2Q08289 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CACNB2Q08289 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CACNB2Q08289 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CACNB2Q08289 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CACNB2Q08289 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
CACNB2Q08289 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CACNB2Q08289 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CACNB2Q08289 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CACNB2Q08289 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CACNB2Q08289 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CACNB2Q08289 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CACNB2Q08289 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
CACNB2Q08289 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
CACNB2Q08289 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CACNB2Q08289 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CACNB2Q08289 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
CACNB2Q08289 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CACNB2Q08289 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CACNB2Q08289 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CACNB2Q08289 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
CACNB2Q08289 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
CACNB2Q08289 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CACNB2Q08289 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CACNB2Q08289 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CACNB2Q08289 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CACNB2Q08289 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CACNB2Q08289 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CACNB2Q08289 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CACNB2Q08289 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CACNB2Q08289 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CACNB2Q08289 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CACNB2Q08289 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CACNB2Q08289 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CACNB2Q08289 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CACNB2Q08289 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CACNB2Q08289 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CACNB2Q08289 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CACNB2Q08289 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CACNB2Q08289 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CACNB2Q08289 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CACNB2Q08289 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CACNB2Q08289 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CACNB2Q08289 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CACNB2Q08289 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
CACNB2Q08289 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CACNB2Q08289 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CACNB2Q08289 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
CACNB2Q08289 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CACNB2Q08289 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CACNB2Q08289 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
CACNB2Q08289 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms