Protein–RNA interactions for Protein: Q06889

EGR3, Early growth response protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EGR3Q06889 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
EGR3Q06889 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
EGR3Q06889 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EGR3Q06889 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EGR3Q06889 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EGR3Q06889 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EGR3Q06889 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EGR3Q06889 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EGR3Q06889 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EGR3Q06889 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EGR3Q06889 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EGR3Q06889 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EGR3Q06889 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EGR3Q06889 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EGR3Q06889 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EGR3Q06889 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EGR3Q06889 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
EGR3Q06889 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EGR3Q06889 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
EGR3Q06889 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EGR3Q06889 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EGR3Q06889 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EGR3Q06889 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EGR3Q06889 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EGR3Q06889 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EGR3Q06889 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EGR3Q06889 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EGR3Q06889 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EGR3Q06889 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EGR3Q06889 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EGR3Q06889 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EGR3Q06889 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EGR3Q06889 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EGR3Q06889 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EGR3Q06889 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EGR3Q06889 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EGR3Q06889 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EGR3Q06889 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EGR3Q06889 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EGR3Q06889 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EGR3Q06889 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EGR3Q06889 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EGR3Q06889 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EGR3Q06889 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EGR3Q06889 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EGR3Q06889 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EGR3Q06889 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EGR3Q06889 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EGR3Q06889 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EGR3Q06889 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EGR3Q06889 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EGR3Q06889 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EGR3Q06889 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EGR3Q06889 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EGR3Q06889 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EGR3Q06889 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EGR3Q06889 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EGR3Q06889 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EGR3Q06889 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EGR3Q06889 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EGR3Q06889 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EGR3Q06889 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EGR3Q06889 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EGR3Q06889 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EGR3Q06889 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EGR3Q06889 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EGR3Q06889 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EGR3Q06889 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EGR3Q06889 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
EGR3Q06889 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EGR3Q06889 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
EGR3Q06889 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EGR3Q06889 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EGR3Q06889 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EGR3Q06889 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EGR3Q06889 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EGR3Q06889 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EGR3Q06889 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EGR3Q06889 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EGR3Q06889 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EGR3Q06889 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
EGR3Q06889 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EGR3Q06889 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EGR3Q06889 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EGR3Q06889 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EGR3Q06889 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EGR3Q06889 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EGR3Q06889 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EGR3Q06889 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EGR3Q06889 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EGR3Q06889 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EGR3Q06889 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
EGR3Q06889 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
EGR3Q06889 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
EGR3Q06889 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EGR3Q06889 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EGR3Q06889 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
EGR3Q06889 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
EGR3Q06889 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EGR3Q06889 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms