Protein–RNA interactions for Protein: Q06546

GABPA, GA-binding protein alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPAQ06546 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GABPAQ06546 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GABPAQ06546 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GABPAQ06546 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GABPAQ06546 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GABPAQ06546 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GABPAQ06546 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GABPAQ06546 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GABPAQ06546 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GABPAQ06546 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GABPAQ06546 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GABPAQ06546 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GABPAQ06546 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GABPAQ06546 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GABPAQ06546 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GABPAQ06546 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GABPAQ06546 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GABPAQ06546 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GABPAQ06546 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GABPAQ06546 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
GABPAQ06546 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GABPAQ06546 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GABPAQ06546 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GABPAQ06546 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GABPAQ06546 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GABPAQ06546 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GABPAQ06546 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GABPAQ06546 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GABPAQ06546 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GABPAQ06546 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
GABPAQ06546 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
GABPAQ06546 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
GABPAQ06546 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
GABPAQ06546 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GABPAQ06546 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GABPAQ06546 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GABPAQ06546 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GABPAQ06546 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GABPAQ06546 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GABPAQ06546 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
GABPAQ06546 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GABPAQ06546 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GABPAQ06546 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GABPAQ06546 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GABPAQ06546 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GABPAQ06546 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GABPAQ06546 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GABPAQ06546 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GABPAQ06546 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GABPAQ06546 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GABPAQ06546 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GABPAQ06546 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GABPAQ06546 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GABPAQ06546 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GABPAQ06546 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GABPAQ06546 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GABPAQ06546 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GABPAQ06546 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GABPAQ06546 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
GABPAQ06546 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GABPAQ06546 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GABPAQ06546 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GABPAQ06546 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GABPAQ06546 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
GABPAQ06546 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GABPAQ06546 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GABPAQ06546 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GABPAQ06546 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GABPAQ06546 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
GABPAQ06546 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GABPAQ06546 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GABPAQ06546 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
GABPAQ06546 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GABPAQ06546 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GABPAQ06546 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GABPAQ06546 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GABPAQ06546 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GABPAQ06546 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
GABPAQ06546 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GABPAQ06546 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
GABPAQ06546 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GABPAQ06546 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
GABPAQ06546 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GABPAQ06546 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GABPAQ06546 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GABPAQ06546 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GABPAQ06546 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GABPAQ06546 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
GABPAQ06546 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GABPAQ06546 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
GABPAQ06546 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GABPAQ06546 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GABPAQ06546 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GABPAQ06546 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GABPAQ06546 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GABPAQ06546 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GABPAQ06546 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GABPAQ06546 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GABPAQ06546 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GABPAQ06546 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms