Protein–RNA interactions for Protein: Q04844

CHRNE, Acetylcholine receptor subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNEQ04844 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CHRNEQ04844 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CHRNEQ04844 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CHRNEQ04844 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CHRNEQ04844 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CHRNEQ04844 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CHRNEQ04844 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CHRNEQ04844 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CHRNEQ04844 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CHRNEQ04844 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CHRNEQ04844 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CHRNEQ04844 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CHRNEQ04844 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CHRNEQ04844 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CHRNEQ04844 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CHRNEQ04844 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CHRNEQ04844 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CHRNEQ04844 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CHRNEQ04844 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CHRNEQ04844 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CHRNEQ04844 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CHRNEQ04844 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CHRNEQ04844 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CHRNEQ04844 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CHRNEQ04844 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CHRNEQ04844 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CHRNEQ04844 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CHRNEQ04844 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CHRNEQ04844 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CHRNEQ04844 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CHRNEQ04844 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CHRNEQ04844 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CHRNEQ04844 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CHRNEQ04844 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CHRNEQ04844 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CHRNEQ04844 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CHRNEQ04844 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CHRNEQ04844 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CHRNEQ04844 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CHRNEQ04844 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CHRNEQ04844 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CHRNEQ04844 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CHRNEQ04844 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CHRNEQ04844 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CHRNEQ04844 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CHRNEQ04844 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CHRNEQ04844 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CHRNEQ04844 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CHRNEQ04844 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CHRNEQ04844 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CHRNEQ04844 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CHRNEQ04844 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CHRNEQ04844 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CHRNEQ04844 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CHRNEQ04844 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CHRNEQ04844 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CHRNEQ04844 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
CHRNEQ04844 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CHRNEQ04844 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CHRNEQ04844 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CHRNEQ04844 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CHRNEQ04844 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CHRNEQ04844 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CHRNEQ04844 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CHRNEQ04844 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CHRNEQ04844 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CHRNEQ04844 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CHRNEQ04844 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CHRNEQ04844 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CHRNEQ04844 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CHRNEQ04844 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
CHRNEQ04844 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CHRNEQ04844 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CHRNEQ04844 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CHRNEQ04844 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CHRNEQ04844 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CHRNEQ04844 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CHRNEQ04844 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CHRNEQ04844 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CHRNEQ04844 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CHRNEQ04844 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CHRNEQ04844 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CHRNEQ04844 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CHRNEQ04844 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CHRNEQ04844 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CHRNEQ04844 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
CHRNEQ04844 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CHRNEQ04844 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CHRNEQ04844 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CHRNEQ04844 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CHRNEQ04844 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CHRNEQ04844 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
CHRNEQ04844 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CHRNEQ04844 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
CHRNEQ04844 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CHRNEQ04844 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CHRNEQ04844 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CHRNEQ04844 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
CHRNEQ04844 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
CHRNEQ04844 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms