Protein–RNA interactions for Protein: Q04837

SSBP1, Single-stranded DNA-binding protein, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSBP1Q04837 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SSBP1Q04837 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SSBP1Q04837 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SSBP1Q04837 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SSBP1Q04837 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SSBP1Q04837 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SSBP1Q04837 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SSBP1Q04837 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SSBP1Q04837 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SSBP1Q04837 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SSBP1Q04837 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SSBP1Q04837 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SSBP1Q04837 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SSBP1Q04837 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SSBP1Q04837 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SSBP1Q04837 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SSBP1Q04837 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SSBP1Q04837 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SSBP1Q04837 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SSBP1Q04837 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SSBP1Q04837 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SSBP1Q04837 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SSBP1Q04837 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SSBP1Q04837 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SSBP1Q04837 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SSBP1Q04837 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SSBP1Q04837 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SSBP1Q04837 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SSBP1Q04837 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SSBP1Q04837 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SSBP1Q04837 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SSBP1Q04837 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SSBP1Q04837 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SSBP1Q04837 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SSBP1Q04837 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SSBP1Q04837 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SSBP1Q04837 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SSBP1Q04837 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SSBP1Q04837 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SSBP1Q04837 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SSBP1Q04837 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SSBP1Q04837 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SSBP1Q04837 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SSBP1Q04837 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SSBP1Q04837 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SSBP1Q04837 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SSBP1Q04837 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SSBP1Q04837 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SSBP1Q04837 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SSBP1Q04837 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SSBP1Q04837 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SSBP1Q04837 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SSBP1Q04837 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SSBP1Q04837 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SSBP1Q04837 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SSBP1Q04837 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SSBP1Q04837 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SSBP1Q04837 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SSBP1Q04837 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SSBP1Q04837 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SSBP1Q04837 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SSBP1Q04837 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SSBP1Q04837 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SSBP1Q04837 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SSBP1Q04837 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SSBP1Q04837 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SSBP1Q04837 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SSBP1Q04837 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SSBP1Q04837 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SSBP1Q04837 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SSBP1Q04837 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SSBP1Q04837 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SSBP1Q04837 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SSBP1Q04837 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SSBP1Q04837 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SSBP1Q04837 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SSBP1Q04837 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SSBP1Q04837 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SSBP1Q04837 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SSBP1Q04837 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SSBP1Q04837 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SSBP1Q04837 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SSBP1Q04837 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SSBP1Q04837 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SSBP1Q04837 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SSBP1Q04837 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SSBP1Q04837 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SSBP1Q04837 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SSBP1Q04837 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SSBP1Q04837 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SSBP1Q04837 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SSBP1Q04837 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SSBP1Q04837 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SSBP1Q04837 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SSBP1Q04837 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SSBP1Q04837 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SSBP1Q04837 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SSBP1Q04837 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SSBP1Q04837 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SSBP1Q04837 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms