Protein–RNA interactions for Protein: Q01362

MS4A2, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A2Q01362 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
MS4A2Q01362 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MS4A2Q01362 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
MS4A2Q01362 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
MS4A2Q01362 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MS4A2Q01362 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
MS4A2Q01362 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MS4A2Q01362 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MS4A2Q01362 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
MS4A2Q01362 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MS4A2Q01362 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
MS4A2Q01362 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
MS4A2Q01362 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MS4A2Q01362 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MS4A2Q01362 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
MS4A2Q01362 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MS4A2Q01362 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MS4A2Q01362 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
MS4A2Q01362 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
MS4A2Q01362 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
MS4A2Q01362 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
MS4A2Q01362 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
MS4A2Q01362 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
MS4A2Q01362 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
MS4A2Q01362 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
MS4A2Q01362 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
MS4A2Q01362 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
MS4A2Q01362 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
MS4A2Q01362 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
MS4A2Q01362 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
MS4A2Q01362 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
MS4A2Q01362 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
MS4A2Q01362 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
MS4A2Q01362 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
MS4A2Q01362 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
MS4A2Q01362 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
MS4A2Q01362 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
MS4A2Q01362 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
MS4A2Q01362 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
MS4A2Q01362 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
MS4A2Q01362 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
MS4A2Q01362 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
MS4A2Q01362 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
MS4A2Q01362 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
MS4A2Q01362 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
MS4A2Q01362 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
MS4A2Q01362 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
MS4A2Q01362 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
MS4A2Q01362 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
MS4A2Q01362 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
MS4A2Q01362 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
MS4A2Q01362 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
MS4A2Q01362 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
MS4A2Q01362 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
MS4A2Q01362 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
MS4A2Q01362 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
MS4A2Q01362 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
MS4A2Q01362 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
MS4A2Q01362 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
MS4A2Q01362 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
MS4A2Q01362 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
MS4A2Q01362 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
MS4A2Q01362 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
MS4A2Q01362 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
MS4A2Q01362 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
MS4A2Q01362 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
MS4A2Q01362 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
MS4A2Q01362 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
MS4A2Q01362 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
MS4A2Q01362 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
MS4A2Q01362 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
MS4A2Q01362 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
MS4A2Q01362 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
MS4A2Q01362 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
MS4A2Q01362 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
MS4A2Q01362 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
MS4A2Q01362 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
MS4A2Q01362 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
MS4A2Q01362 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
MS4A2Q01362 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
MS4A2Q01362 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
MS4A2Q01362 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
MS4A2Q01362 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
MS4A2Q01362 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
MS4A2Q01362 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
MS4A2Q01362 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
MS4A2Q01362 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
MS4A2Q01362 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
MS4A2Q01362 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
MS4A2Q01362 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
MS4A2Q01362 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
MS4A2Q01362 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
MS4A2Q01362 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
MS4A2Q01362 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
MS4A2Q01362 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
MS4A2Q01362 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
MS4A2Q01362 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
MS4A2Q01362 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
MS4A2Q01362 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
MS4A2Q01362 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.3 ms