Protein–RNA interactions for Protein: Q00LT1

PRCD, Progressive rod-cone degeneration protein, humanhuman

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Length 54 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRCDQ00LT1 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
PRCDQ00LT1 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
PRCDQ00LT1 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
PRCDQ00LT1 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PRCDQ00LT1 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PRCDQ00LT1 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PRCDQ00LT1 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PRCDQ00LT1 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PRCDQ00LT1 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
PRCDQ00LT1 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
PRCDQ00LT1 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PRCDQ00LT1 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PRCDQ00LT1 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PRCDQ00LT1 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PRCDQ00LT1 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PRCDQ00LT1 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PRCDQ00LT1 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PRCDQ00LT1 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PRCDQ00LT1 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PRCDQ00LT1 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PRCDQ00LT1 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PRCDQ00LT1 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PRCDQ00LT1 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PRCDQ00LT1 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PRCDQ00LT1 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PRCDQ00LT1 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PRCDQ00LT1 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PRCDQ00LT1 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PRCDQ00LT1 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PRCDQ00LT1 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PRCDQ00LT1 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
PRCDQ00LT1 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PRCDQ00LT1 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PRCDQ00LT1 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PRCDQ00LT1 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PRCDQ00LT1 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
PRCDQ00LT1 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
PRCDQ00LT1 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
PRCDQ00LT1 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PRCDQ00LT1 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
PRCDQ00LT1 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PRCDQ00LT1 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PRCDQ00LT1 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PRCDQ00LT1 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PRCDQ00LT1 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PRCDQ00LT1 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PRCDQ00LT1 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PRCDQ00LT1 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PRCDQ00LT1 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PRCDQ00LT1 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PRCDQ00LT1 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PRCDQ00LT1 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PRCDQ00LT1 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PRCDQ00LT1 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PRCDQ00LT1 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PRCDQ00LT1 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PRCDQ00LT1 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PRCDQ00LT1 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PRCDQ00LT1 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PRCDQ00LT1 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PRCDQ00LT1 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PRCDQ00LT1 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PRCDQ00LT1 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PRCDQ00LT1 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PRCDQ00LT1 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PRCDQ00LT1 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PRCDQ00LT1 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PRCDQ00LT1 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PRCDQ00LT1 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
PRCDQ00LT1 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
PRCDQ00LT1 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PRCDQ00LT1 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
PRCDQ00LT1 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PRCDQ00LT1 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PRCDQ00LT1 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PRCDQ00LT1 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PRCDQ00LT1 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PRCDQ00LT1 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PRCDQ00LT1 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PRCDQ00LT1 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PRCDQ00LT1 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PRCDQ00LT1 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PRCDQ00LT1 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PRCDQ00LT1 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PRCDQ00LT1 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PRCDQ00LT1 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
PRCDQ00LT1 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
PRCDQ00LT1 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
PRCDQ00LT1 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
PRCDQ00LT1 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
PRCDQ00LT1 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PRCDQ00LT1 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PRCDQ00LT1 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PRCDQ00LT1 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PRCDQ00LT1 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PRCDQ00LT1 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PRCDQ00LT1 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PRCDQ00LT1 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PRCDQ00LT1 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PRCDQ00LT1 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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