Protein–RNA interactions for Protein: Q00987

MDM2, E3 ubiquitin-protein ligase Mdm2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDM2Q00987 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MDM2Q00987 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MDM2Q00987 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
MDM2Q00987 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MDM2Q00987 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
MDM2Q00987 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
MDM2Q00987 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
MDM2Q00987 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MDM2Q00987 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MDM2Q00987 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MDM2Q00987 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MDM2Q00987 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
MDM2Q00987 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MDM2Q00987 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MDM2Q00987 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
MDM2Q00987 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MDM2Q00987 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MDM2Q00987 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
MDM2Q00987 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
MDM2Q00987 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MDM2Q00987 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
MDM2Q00987 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MDM2Q00987 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
MDM2Q00987 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
MDM2Q00987 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
MDM2Q00987 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
MDM2Q00987 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
MDM2Q00987 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
MDM2Q00987 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
MDM2Q00987 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
MDM2Q00987 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
MDM2Q00987 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
MDM2Q00987 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
MDM2Q00987 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
MDM2Q00987 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
MDM2Q00987 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
MDM2Q00987 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
MDM2Q00987 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
MDM2Q00987 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
MDM2Q00987 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
MDM2Q00987 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
MDM2Q00987 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
MDM2Q00987 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
MDM2Q00987 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
MDM2Q00987 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
MDM2Q00987 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
MDM2Q00987 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
MDM2Q00987 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
MDM2Q00987 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
MDM2Q00987 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
MDM2Q00987 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
MDM2Q00987 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
MDM2Q00987 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
MDM2Q00987 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
MDM2Q00987 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
MDM2Q00987 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
MDM2Q00987 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
MDM2Q00987 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
MDM2Q00987 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
MDM2Q00987 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
MDM2Q00987 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
MDM2Q00987 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
MDM2Q00987 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
MDM2Q00987 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
MDM2Q00987 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
MDM2Q00987 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
MDM2Q00987 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
MDM2Q00987 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
MDM2Q00987 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
MDM2Q00987 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
MDM2Q00987 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
MDM2Q00987 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
MDM2Q00987 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
MDM2Q00987 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
MDM2Q00987 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
MDM2Q00987 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
MDM2Q00987 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
MDM2Q00987 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
MDM2Q00987 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
MDM2Q00987 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
MDM2Q00987 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
MDM2Q00987 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
MDM2Q00987 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
MDM2Q00987 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
MDM2Q00987 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
MDM2Q00987 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
MDM2Q00987 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
MDM2Q00987 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
MDM2Q00987 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
MDM2Q00987 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
MDM2Q00987 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
MDM2Q00987 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC21.04■□□□□ 0.96
MDM2Q00987 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
MDM2Q00987 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
MDM2Q00987 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC21.04■□□□□ 0.96
MDM2Q00987 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
MDM2Q00987 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
MDM2Q00987 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
MDM2Q00987 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
MDM2Q00987 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms