Protein–RNA interactions for Protein: Q00169

PITPNA, Phosphatidylinositol transfer protein alpha isoform, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITPNAQ00169 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PITPNAQ00169 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PITPNAQ00169 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PITPNAQ00169 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PITPNAQ00169 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
PITPNAQ00169 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PITPNAQ00169 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PITPNAQ00169 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PITPNAQ00169 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PITPNAQ00169 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PITPNAQ00169 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PITPNAQ00169 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
PITPNAQ00169 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PITPNAQ00169 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PITPNAQ00169 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PITPNAQ00169 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PITPNAQ00169 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PITPNAQ00169 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
PITPNAQ00169 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
PITPNAQ00169 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PITPNAQ00169 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
PITPNAQ00169 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PITPNAQ00169 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PITPNAQ00169 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
PITPNAQ00169 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
PITPNAQ00169 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
PITPNAQ00169 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
PITPNAQ00169 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
PITPNAQ00169 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
PITPNAQ00169 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
PITPNAQ00169 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
PITPNAQ00169 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
PITPNAQ00169 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PITPNAQ00169 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PITPNAQ00169 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PITPNAQ00169 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PITPNAQ00169 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PITPNAQ00169 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PITPNAQ00169 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PITPNAQ00169 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PITPNAQ00169 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PITPNAQ00169 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PITPNAQ00169 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PITPNAQ00169 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PITPNAQ00169 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PITPNAQ00169 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PITPNAQ00169 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PITPNAQ00169 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PITPNAQ00169 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PITPNAQ00169 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PITPNAQ00169 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PITPNAQ00169 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PITPNAQ00169 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PITPNAQ00169 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PITPNAQ00169 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PITPNAQ00169 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PITPNAQ00169 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PITPNAQ00169 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PITPNAQ00169 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PITPNAQ00169 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PITPNAQ00169 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PITPNAQ00169 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PITPNAQ00169 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PITPNAQ00169 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PITPNAQ00169 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PITPNAQ00169 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PITPNAQ00169 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PITPNAQ00169 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PITPNAQ00169 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PITPNAQ00169 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PITPNAQ00169 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PITPNAQ00169 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PITPNAQ00169 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PITPNAQ00169 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PITPNAQ00169 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PITPNAQ00169 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PITPNAQ00169 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PITPNAQ00169 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PITPNAQ00169 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PITPNAQ00169 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PITPNAQ00169 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PITPNAQ00169 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PITPNAQ00169 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PITPNAQ00169 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PITPNAQ00169 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PITPNAQ00169 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PITPNAQ00169 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PITPNAQ00169 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PITPNAQ00169 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PITPNAQ00169 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PITPNAQ00169 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PITPNAQ00169 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PITPNAQ00169 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PITPNAQ00169 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PITPNAQ00169 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PITPNAQ00169 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PITPNAQ00169 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PITPNAQ00169 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PITPNAQ00169 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PITPNAQ00169 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms