Protein–RNA interactions for Protein: P98174

FGD1, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 961 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGD1P98174 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
FGD1P98174 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
FGD1P98174 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FGD1P98174 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
FGD1P98174 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
FGD1P98174 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FGD1P98174 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FGD1P98174 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FGD1P98174 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
FGD1P98174 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FGD1P98174 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FGD1P98174 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FGD1P98174 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FGD1P98174 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FGD1P98174 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
FGD1P98174 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FGD1P98174 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FGD1P98174 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
FGD1P98174 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
FGD1P98174 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
FGD1P98174 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FGD1P98174 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
FGD1P98174 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
FGD1P98174 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FGD1P98174 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FGD1P98174 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FGD1P98174 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FGD1P98174 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FGD1P98174 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FGD1P98174 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FGD1P98174 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
FGD1P98174 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FGD1P98174 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FGD1P98174 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FGD1P98174 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FGD1P98174 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FGD1P98174 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FGD1P98174 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FGD1P98174 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
FGD1P98174 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
FGD1P98174 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
FGD1P98174 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
FGD1P98174 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
FGD1P98174 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
FGD1P98174 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
FGD1P98174 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
FGD1P98174 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FGD1P98174 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
FGD1P98174 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FGD1P98174 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FGD1P98174 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FGD1P98174 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FGD1P98174 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FGD1P98174 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
FGD1P98174 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FGD1P98174 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
FGD1P98174 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
FGD1P98174 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FGD1P98174 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
FGD1P98174 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
FGD1P98174 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
FGD1P98174 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FGD1P98174 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
FGD1P98174 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FGD1P98174 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FGD1P98174 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FGD1P98174 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FGD1P98174 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FGD1P98174 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
FGD1P98174 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
FGD1P98174 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FGD1P98174 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FGD1P98174 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
FGD1P98174 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
FGD1P98174 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FGD1P98174 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
FGD1P98174 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
FGD1P98174 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
FGD1P98174 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
FGD1P98174 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FGD1P98174 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
FGD1P98174 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FGD1P98174 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FGD1P98174 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FGD1P98174 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FGD1P98174 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
FGD1P98174 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FGD1P98174 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
FGD1P98174 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
FGD1P98174 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FGD1P98174 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FGD1P98174 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
FGD1P98174 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
FGD1P98174 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
FGD1P98174 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
FGD1P98174 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FGD1P98174 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FGD1P98174 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
FGD1P98174 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
FGD1P98174 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms