Protein–RNA interactions for Protein: P81877

SSBP2, Single-stranded DNA-binding protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 361 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSBP2P81877 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SSBP2P81877 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SSBP2P81877 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SSBP2P81877 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SSBP2P81877 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SSBP2P81877 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SSBP2P81877 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SSBP2P81877 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SSBP2P81877 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SSBP2P81877 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
SSBP2P81877 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SSBP2P81877 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SSBP2P81877 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SSBP2P81877 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SSBP2P81877 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SSBP2P81877 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SSBP2P81877 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SSBP2P81877 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SSBP2P81877 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
SSBP2P81877 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SSBP2P81877 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SSBP2P81877 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SSBP2P81877 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SSBP2P81877 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SSBP2P81877 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SSBP2P81877 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SSBP2P81877 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SSBP2P81877 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
SSBP2P81877 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SSBP2P81877 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SSBP2P81877 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SSBP2P81877 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SSBP2P81877 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SSBP2P81877 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SSBP2P81877 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SSBP2P81877 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SSBP2P81877 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SSBP2P81877 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SSBP2P81877 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SSBP2P81877 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SSBP2P81877 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SSBP2P81877 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SSBP2P81877 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SSBP2P81877 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SSBP2P81877 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SSBP2P81877 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SSBP2P81877 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SSBP2P81877 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SSBP2P81877 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SSBP2P81877 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SSBP2P81877 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SSBP2P81877 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SSBP2P81877 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SSBP2P81877 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SSBP2P81877 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SSBP2P81877 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SSBP2P81877 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SSBP2P81877 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SSBP2P81877 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SSBP2P81877 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SSBP2P81877 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SSBP2P81877 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SSBP2P81877 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SSBP2P81877 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SSBP2P81877 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SSBP2P81877 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SSBP2P81877 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SSBP2P81877 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SSBP2P81877 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SSBP2P81877 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SSBP2P81877 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SSBP2P81877 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
SSBP2P81877 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SSBP2P81877 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SSBP2P81877 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SSBP2P81877 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SSBP2P81877 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
SSBP2P81877 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
SSBP2P81877 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SSBP2P81877 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SSBP2P81877 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SSBP2P81877 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SSBP2P81877 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
SSBP2P81877 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SSBP2P81877 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SSBP2P81877 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SSBP2P81877 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SSBP2P81877 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SSBP2P81877 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SSBP2P81877 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SSBP2P81877 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SSBP2P81877 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SSBP2P81877 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SSBP2P81877 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SSBP2P81877 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SSBP2P81877 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SSBP2P81877 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SSBP2P81877 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SSBP2P81877 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SSBP2P81877 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.3 ms