Protein–RNA interactions for Protein: P63121

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Pro protein, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P63121 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
HERVK_113P63121 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
HERVK_113P63121 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
HERVK_113P63121 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
HERVK_113P63121 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
HERVK_113P63121 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
HERVK_113P63121 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
HERVK_113P63121 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
HERVK_113P63121 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
HERVK_113P63121 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
HERVK_113P63121 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
HERVK_113P63121 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
HERVK_113P63121 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
HERVK_113P63121 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
HERVK_113P63121 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
HERVK_113P63121 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
HERVK_113P63121 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
HERVK_113P63121 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
HERVK_113P63121 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
HERVK_113P63121 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
HERVK_113P63121 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
HERVK_113P63121 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
HERVK_113P63121 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
HERVK_113P63121 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
HERVK_113P63121 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
HERVK_113P63121 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
HERVK_113P63121 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
HERVK_113P63121 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
HERVK_113P63121 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
HERVK_113P63121 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
HERVK_113P63121 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
HERVK_113P63121 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
HERVK_113P63121 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
HERVK_113P63121 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
HERVK_113P63121 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
HERVK_113P63121 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
HERVK_113P63121 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
HERVK_113P63121 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
HERVK_113P63121 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
HERVK_113P63121 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
HERVK_113P63121 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
HERVK_113P63121 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
HERVK_113P63121 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
HERVK_113P63121 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
HERVK_113P63121 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
HERVK_113P63121 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
HERVK_113P63121 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
HERVK_113P63121 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
HERVK_113P63121 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
HERVK_113P63121 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.39
HERVK_113P63121 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.39
HERVK_113P63121 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.39
HERVK_113P63121 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
HERVK_113P63121 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
HERVK_113P63121 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
HERVK_113P63121 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
HERVK_113P63121 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC12.64□□□□□ -0.39
HERVK_113P63121 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
HERVK_113P63121 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
HERVK_113P63121 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
HERVK_113P63121 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
HERVK_113P63121 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
HERVK_113P63121 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
HERVK_113P63121 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
HERVK_113P63121 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
HERVK_113P63121 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
HERVK_113P63121 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
HERVK_113P63121 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
HERVK_113P63121 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
HERVK_113P63121 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
HERVK_113P63121 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
HERVK_113P63121 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
HERVK_113P63121 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
HERVK_113P63121 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
HERVK_113P63121 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
HERVK_113P63121 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
HERVK_113P63121 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
HERVK_113P63121 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
HERVK_113P63121 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
HERVK_113P63121 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
HERVK_113P63121 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
HERVK_113P63121 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
HERVK_113P63121 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
HERVK_113P63121 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
HERVK_113P63121 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
HERVK_113P63121 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
HERVK_113P63121 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
HERVK_113P63121 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
HERVK_113P63121 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
HERVK_113P63121 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
HERVK_113P63121 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
HERVK_113P63121 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
HERVK_113P63121 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
HERVK_113P63121 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
HERVK_113P63121 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
HERVK_113P63121 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
HERVK_113P63121 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
HERVK_113P63121 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
HERVK_113P63121 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
HERVK_113P63121 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms