Protein–RNA interactions for Protein: P62820

RAB1A, Ras-related protein Rab-1A, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB1AP62820 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB1AP62820 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB1AP62820 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB1AP62820 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB1AP62820 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB1AP62820 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB1AP62820 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB1AP62820 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB1AP62820 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB1AP62820 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB1AP62820 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB1AP62820 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB1AP62820 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB1AP62820 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB1AP62820 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB1AP62820 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB1AP62820 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB1AP62820 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB1AP62820 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB1AP62820 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB1AP62820 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB1AP62820 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB1AP62820 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB1AP62820 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB1AP62820 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB1AP62820 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB1AP62820 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB1AP62820 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB1AP62820 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB1AP62820 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB1AP62820 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB1AP62820 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB1AP62820 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB1AP62820 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB1AP62820 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB1AP62820 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB1AP62820 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB1AP62820 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB1AP62820 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB1AP62820 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB1AP62820 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB1AP62820 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB1AP62820 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB1AP62820 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB1AP62820 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB1AP62820 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB1AP62820 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB1AP62820 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB1AP62820 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB1AP62820 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB1AP62820 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB1AP62820 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB1AP62820 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB1AP62820 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB1AP62820 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB1AP62820 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB1AP62820 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB1AP62820 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB1AP62820 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB1AP62820 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB1AP62820 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB1AP62820 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB1AP62820 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB1AP62820 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB1AP62820 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB1AP62820 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB1AP62820 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB1AP62820 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB1AP62820 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB1AP62820 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB1AP62820 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB1AP62820 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB1AP62820 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB1AP62820 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB1AP62820 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB1AP62820 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB1AP62820 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB1AP62820 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB1AP62820 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB1AP62820 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB1AP62820 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB1AP62820 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB1AP62820 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB1AP62820 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB1AP62820 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB1AP62820 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB1AP62820 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB1AP62820 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB1AP62820 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB1AP62820 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB1AP62820 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB1AP62820 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB1AP62820 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB1AP62820 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB1AP62820 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB1AP62820 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB1AP62820 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB1AP62820 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB1AP62820 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB1AP62820 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms