Protein–RNA interactions for Protein: P62316

SNRPD2, Small nuclear ribonucleoprotein Sm D2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPD2P62316 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SNRPD2P62316 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SNRPD2P62316 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SNRPD2P62316 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SNRPD2P62316 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SNRPD2P62316 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SNRPD2P62316 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SNRPD2P62316 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SNRPD2P62316 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SNRPD2P62316 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SNRPD2P62316 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SNRPD2P62316 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SNRPD2P62316 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SNRPD2P62316 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SNRPD2P62316 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SNRPD2P62316 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SNRPD2P62316 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SNRPD2P62316 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SNRPD2P62316 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SNRPD2P62316 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SNRPD2P62316 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SNRPD2P62316 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNRPD2P62316 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNRPD2P62316 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNRPD2P62316 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNRPD2P62316 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNRPD2P62316 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNRPD2P62316 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNRPD2P62316 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNRPD2P62316 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNRPD2P62316 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNRPD2P62316 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNRPD2P62316 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNRPD2P62316 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNRPD2P62316 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNRPD2P62316 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNRPD2P62316 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNRPD2P62316 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNRPD2P62316 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNRPD2P62316 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNRPD2P62316 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNRPD2P62316 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SNRPD2P62316 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNRPD2P62316 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNRPD2P62316 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNRPD2P62316 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNRPD2P62316 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNRPD2P62316 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNRPD2P62316 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNRPD2P62316 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNRPD2P62316 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNRPD2P62316 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNRPD2P62316 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNRPD2P62316 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNRPD2P62316 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNRPD2P62316 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNRPD2P62316 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNRPD2P62316 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNRPD2P62316 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNRPD2P62316 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNRPD2P62316 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNRPD2P62316 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNRPD2P62316 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNRPD2P62316 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNRPD2P62316 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNRPD2P62316 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNRPD2P62316 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNRPD2P62316 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNRPD2P62316 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNRPD2P62316 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNRPD2P62316 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SNRPD2P62316 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNRPD2P62316 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SNRPD2P62316 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNRPD2P62316 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SNRPD2P62316 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNRPD2P62316 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNRPD2P62316 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNRPD2P62316 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNRPD2P62316 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNRPD2P62316 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SNRPD2P62316 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNRPD2P62316 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNRPD2P62316 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNRPD2P62316 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNRPD2P62316 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNRPD2P62316 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNRPD2P62316 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNRPD2P62316 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNRPD2P62316 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNRPD2P62316 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNRPD2P62316 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNRPD2P62316 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNRPD2P62316 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNRPD2P62316 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNRPD2P62316 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNRPD2P62316 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNRPD2P62316 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNRPD2P62316 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNRPD2P62316 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms