Protein–RNA interactions for Protein: P61550

ERVS71-1, Endogenous retrovirus group S71 member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 626 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVS71-1P61550 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ERVS71-1P61550 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ERVS71-1P61550 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ERVS71-1P61550 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ERVS71-1P61550 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ERVS71-1P61550 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ERVS71-1P61550 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ERVS71-1P61550 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ERVS71-1P61550 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ERVS71-1P61550 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ERVS71-1P61550 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ERVS71-1P61550 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ERVS71-1P61550 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ERVS71-1P61550 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ERVS71-1P61550 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ERVS71-1P61550 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ERVS71-1P61550 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ERVS71-1P61550 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
ERVS71-1P61550 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ERVS71-1P61550 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ERVS71-1P61550 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ERVS71-1P61550 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ERVS71-1P61550 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ERVS71-1P61550 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ERVS71-1P61550 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ERVS71-1P61550 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ERVS71-1P61550 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ERVS71-1P61550 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ERVS71-1P61550 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
ERVS71-1P61550 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ERVS71-1P61550 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ERVS71-1P61550 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ERVS71-1P61550 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ERVS71-1P61550 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
ERVS71-1P61550 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
ERVS71-1P61550 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ERVS71-1P61550 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ERVS71-1P61550 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ERVS71-1P61550 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ERVS71-1P61550 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
ERVS71-1P61550 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ERVS71-1P61550 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ERVS71-1P61550 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
ERVS71-1P61550 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ERVS71-1P61550 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ERVS71-1P61550 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ERVS71-1P61550 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ERVS71-1P61550 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
ERVS71-1P61550 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
ERVS71-1P61550 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ERVS71-1P61550 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ERVS71-1P61550 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ERVS71-1P61550 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ERVS71-1P61550 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ERVS71-1P61550 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
ERVS71-1P61550 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ERVS71-1P61550 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ERVS71-1P61550 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ERVS71-1P61550 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ERVS71-1P61550 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ERVS71-1P61550 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ERVS71-1P61550 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ERVS71-1P61550 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
ERVS71-1P61550 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ERVS71-1P61550 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ERVS71-1P61550 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
ERVS71-1P61550 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ERVS71-1P61550 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
ERVS71-1P61550 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ERVS71-1P61550 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ERVS71-1P61550 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ERVS71-1P61550 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ERVS71-1P61550 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ERVS71-1P61550 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ERVS71-1P61550 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ERVS71-1P61550 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ERVS71-1P61550 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
ERVS71-1P61550 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ERVS71-1P61550 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ERVS71-1P61550 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
ERVS71-1P61550 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ERVS71-1P61550 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ERVS71-1P61550 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ERVS71-1P61550 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ERVS71-1P61550 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ERVS71-1P61550 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ERVS71-1P61550 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ERVS71-1P61550 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ERVS71-1P61550 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ERVS71-1P61550 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ERVS71-1P61550 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ERVS71-1P61550 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ERVS71-1P61550 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ERVS71-1P61550 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ERVS71-1P61550 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ERVS71-1P61550 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ERVS71-1P61550 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ERVS71-1P61550 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ERVS71-1P61550 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ERVS71-1P61550 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms