Protein–RNA interactions for Protein: P59190

RAB15, Ras-related protein Rab-15, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB15P59190 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RAB15P59190 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RAB15P59190 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
RAB15P59190 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RAB15P59190 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RAB15P59190 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
RAB15P59190 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RAB15P59190 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
RAB15P59190 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RAB15P59190 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RAB15P59190 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RAB15P59190 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RAB15P59190 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RAB15P59190 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RAB15P59190 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RAB15P59190 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RAB15P59190 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RAB15P59190 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RAB15P59190 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
RAB15P59190 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RAB15P59190 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
RAB15P59190 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RAB15P59190 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
RAB15P59190 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RAB15P59190 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
RAB15P59190 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RAB15P59190 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RAB15P59190 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RAB15P59190 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RAB15P59190 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RAB15P59190 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RAB15P59190 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RAB15P59190 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RAB15P59190 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RAB15P59190 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RAB15P59190 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RAB15P59190 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RAB15P59190 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RAB15P59190 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RAB15P59190 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RAB15P59190 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RAB15P59190 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RAB15P59190 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RAB15P59190 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RAB15P59190 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
RAB15P59190 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RAB15P59190 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RAB15P59190 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RAB15P59190 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RAB15P59190 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RAB15P59190 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAB15P59190 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAB15P59190 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAB15P59190 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAB15P59190 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAB15P59190 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAB15P59190 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAB15P59190 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAB15P59190 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAB15P59190 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAB15P59190 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAB15P59190 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAB15P59190 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAB15P59190 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAB15P59190 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAB15P59190 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAB15P59190 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAB15P59190 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAB15P59190 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAB15P59190 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAB15P59190 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
RAB15P59190 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAB15P59190 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAB15P59190 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAB15P59190 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAB15P59190 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
RAB15P59190 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAB15P59190 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAB15P59190 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAB15P59190 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAB15P59190 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
RAB15P59190 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAB15P59190 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAB15P59190 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAB15P59190 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
RAB15P59190 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAB15P59190 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAB15P59190 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
RAB15P59190 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAB15P59190 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAB15P59190 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAB15P59190 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAB15P59190 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAB15P59190 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAB15P59190 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAB15P59190 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAB15P59190 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAB15P59190 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAB15P59190 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAB15P59190 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms