Protein–RNA interactions for Protein: P57796

CABP4, Calcium-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CABP4P57796 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CABP4P57796 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CABP4P57796 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CABP4P57796 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CABP4P57796 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CABP4P57796 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CABP4P57796 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CABP4P57796 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CABP4P57796 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CABP4P57796 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CABP4P57796 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CABP4P57796 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CABP4P57796 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CABP4P57796 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CABP4P57796 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
CABP4P57796 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
CABP4P57796 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CABP4P57796 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CABP4P57796 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CABP4P57796 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
CABP4P57796 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CABP4P57796 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CABP4P57796 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CABP4P57796 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CABP4P57796 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CABP4P57796 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CABP4P57796 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CABP4P57796 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CABP4P57796 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CABP4P57796 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CABP4P57796 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CABP4P57796 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CABP4P57796 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CABP4P57796 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CABP4P57796 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CABP4P57796 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CABP4P57796 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CABP4P57796 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CABP4P57796 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CABP4P57796 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CABP4P57796 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CABP4P57796 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CABP4P57796 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CABP4P57796 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CABP4P57796 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
CABP4P57796 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
CABP4P57796 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CABP4P57796 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CABP4P57796 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CABP4P57796 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CABP4P57796 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CABP4P57796 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CABP4P57796 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CABP4P57796 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CABP4P57796 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CABP4P57796 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CABP4P57796 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CABP4P57796 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CABP4P57796 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CABP4P57796 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CABP4P57796 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CABP4P57796 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CABP4P57796 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
CABP4P57796 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CABP4P57796 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CABP4P57796 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CABP4P57796 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CABP4P57796 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CABP4P57796 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CABP4P57796 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CABP4P57796 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CABP4P57796 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CABP4P57796 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CABP4P57796 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CABP4P57796 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CABP4P57796 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CABP4P57796 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CABP4P57796 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CABP4P57796 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CABP4P57796 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CABP4P57796 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CABP4P57796 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CABP4P57796 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CABP4P57796 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CABP4P57796 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CABP4P57796 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CABP4P57796 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CABP4P57796 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CABP4P57796 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CABP4P57796 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CABP4P57796 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CABP4P57796 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CABP4P57796 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CABP4P57796 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CABP4P57796 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CABP4P57796 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CABP4P57796 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CABP4P57796 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CABP4P57796 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CABP4P57796 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms