Protein–RNA interactions for Protein: P56278

MTCP1, Protein p13 MTCP-1, humanhuman

Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTCP1P56278 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MTCP1P56278 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MTCP1P56278 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MTCP1P56278 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MTCP1P56278 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MTCP1P56278 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MTCP1P56278 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MTCP1P56278 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MTCP1P56278 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MTCP1P56278 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MTCP1P56278 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MTCP1P56278 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MTCP1P56278 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MTCP1P56278 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MTCP1P56278 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MTCP1P56278 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MTCP1P56278 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MTCP1P56278 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MTCP1P56278 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MTCP1P56278 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MTCP1P56278 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MTCP1P56278 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MTCP1P56278 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MTCP1P56278 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MTCP1P56278 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MTCP1P56278 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MTCP1P56278 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MTCP1P56278 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MTCP1P56278 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MTCP1P56278 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MTCP1P56278 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MTCP1P56278 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MTCP1P56278 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MTCP1P56278 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
MTCP1P56278 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
MTCP1P56278 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
MTCP1P56278 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
MTCP1P56278 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
MTCP1P56278 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
MTCP1P56278 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
MTCP1P56278 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
MTCP1P56278 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
MTCP1P56278 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
MTCP1P56278 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
MTCP1P56278 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
MTCP1P56278 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
MTCP1P56278 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
MTCP1P56278 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
MTCP1P56278 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MTCP1P56278 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MTCP1P56278 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MTCP1P56278 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MTCP1P56278 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MTCP1P56278 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MTCP1P56278 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MTCP1P56278 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MTCP1P56278 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MTCP1P56278 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MTCP1P56278 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MTCP1P56278 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
MTCP1P56278 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MTCP1P56278 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MTCP1P56278 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MTCP1P56278 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MTCP1P56278 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MTCP1P56278 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MTCP1P56278 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MTCP1P56278 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MTCP1P56278 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MTCP1P56278 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MTCP1P56278 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
MTCP1P56278 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
MTCP1P56278 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MTCP1P56278 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MTCP1P56278 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MTCP1P56278 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MTCP1P56278 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MTCP1P56278 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MTCP1P56278 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MTCP1P56278 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MTCP1P56278 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MTCP1P56278 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MTCP1P56278 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MTCP1P56278 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MTCP1P56278 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MTCP1P56278 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MTCP1P56278 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MTCP1P56278 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MTCP1P56278 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MTCP1P56278 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MTCP1P56278 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MTCP1P56278 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MTCP1P56278 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MTCP1P56278 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MTCP1P56278 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MTCP1P56278 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MTCP1P56278 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MTCP1P56278 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MTCP1P56278 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MTCP1P56278 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms