Protein–RNA interactions for Protein: P54284

CACNB3, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB3P54284 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CACNB3P54284 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CACNB3P54284 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CACNB3P54284 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
CACNB3P54284 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CACNB3P54284 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CACNB3P54284 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CACNB3P54284 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
CACNB3P54284 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CACNB3P54284 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CACNB3P54284 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
CACNB3P54284 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CACNB3P54284 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CACNB3P54284 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CACNB3P54284 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CACNB3P54284 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CACNB3P54284 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CACNB3P54284 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CACNB3P54284 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CACNB3P54284 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CACNB3P54284 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CACNB3P54284 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CACNB3P54284 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CACNB3P54284 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CACNB3P54284 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CACNB3P54284 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CACNB3P54284 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CACNB3P54284 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CACNB3P54284 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CACNB3P54284 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CACNB3P54284 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CACNB3P54284 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CACNB3P54284 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CACNB3P54284 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CACNB3P54284 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CACNB3P54284 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CACNB3P54284 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CACNB3P54284 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CACNB3P54284 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CACNB3P54284 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CACNB3P54284 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CACNB3P54284 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CACNB3P54284 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CACNB3P54284 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CACNB3P54284 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CACNB3P54284 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CACNB3P54284 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CACNB3P54284 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CACNB3P54284 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CACNB3P54284 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CACNB3P54284 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CACNB3P54284 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CACNB3P54284 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CACNB3P54284 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CACNB3P54284 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CACNB3P54284 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CACNB3P54284 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CACNB3P54284 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CACNB3P54284 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CACNB3P54284 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CACNB3P54284 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CACNB3P54284 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CACNB3P54284 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CACNB3P54284 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CACNB3P54284 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CACNB3P54284 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CACNB3P54284 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CACNB3P54284 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CACNB3P54284 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CACNB3P54284 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CACNB3P54284 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CACNB3P54284 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CACNB3P54284 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CACNB3P54284 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CACNB3P54284 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CACNB3P54284 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CACNB3P54284 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CACNB3P54284 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CACNB3P54284 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CACNB3P54284 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CACNB3P54284 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CACNB3P54284 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CACNB3P54284 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CACNB3P54284 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CACNB3P54284 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CACNB3P54284 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CACNB3P54284 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CACNB3P54284 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CACNB3P54284 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CACNB3P54284 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
CACNB3P54284 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CACNB3P54284 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CACNB3P54284 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CACNB3P54284 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
CACNB3P54284 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CACNB3P54284 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CACNB3P54284 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CACNB3P54284 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CACNB3P54284 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CACNB3P54284 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms