Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PGGT1BP53609 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PGGT1BP53609 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PGGT1BP53609 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PGGT1BP53609 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PGGT1BP53609 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PGGT1BP53609 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PGGT1BP53609 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PGGT1BP53609 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PGGT1BP53609 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PGGT1BP53609 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PGGT1BP53609 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PGGT1BP53609 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PGGT1BP53609 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PGGT1BP53609 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PGGT1BP53609 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PGGT1BP53609 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PGGT1BP53609 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PGGT1BP53609 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PGGT1BP53609 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PGGT1BP53609 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PGGT1BP53609 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PGGT1BP53609 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PGGT1BP53609 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PGGT1BP53609 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PGGT1BP53609 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
PGGT1BP53609 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PGGT1BP53609 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PGGT1BP53609 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PGGT1BP53609 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PGGT1BP53609 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PGGT1BP53609 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PGGT1BP53609 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PGGT1BP53609 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PGGT1BP53609 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PGGT1BP53609 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PGGT1BP53609 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PGGT1BP53609 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PGGT1BP53609 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PGGT1BP53609 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PGGT1BP53609 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PGGT1BP53609 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PGGT1BP53609 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PGGT1BP53609 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PGGT1BP53609 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PGGT1BP53609 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PGGT1BP53609 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
PGGT1BP53609 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PGGT1BP53609 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PGGT1BP53609 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PGGT1BP53609 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PGGT1BP53609 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
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PGGT1BP53609 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PGGT1BP53609 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
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PGGT1BP53609 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
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PGGT1BP53609 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
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PGGT1BP53609 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
PGGT1BP53609 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PGGT1BP53609 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PGGT1BP53609 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PGGT1BP53609 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PGGT1BP53609 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PGGT1BP53609 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
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PGGT1BP53609 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PGGT1BP53609 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PGGT1BP53609 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PGGT1BP53609 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
PGGT1BP53609 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
PGGT1BP53609 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
PGGT1BP53609 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
PGGT1BP53609 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PGGT1BP53609 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PGGT1BP53609 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
PGGT1BP53609 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PGGT1BP53609 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PGGT1BP53609 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
PGGT1BP53609 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PGGT1BP53609 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PGGT1BP53609 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PGGT1BP53609 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PGGT1BP53609 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PGGT1BP53609 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PGGT1BP53609 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PGGT1BP53609 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
PGGT1BP53609 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PGGT1BP53609 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PGGT1BP53609 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PGGT1BP53609 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
PGGT1BP53609 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PGGT1BP53609 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PGGT1BP53609 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PGGT1BP53609 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
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