Protein–RNA interactions for Protein: P49674

CSNK1E, Casein kinase I isoform epsilon, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK1EP49674 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CSNK1EP49674 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
CSNK1EP49674 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
CSNK1EP49674 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CSNK1EP49674 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CSNK1EP49674 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CSNK1EP49674 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
CSNK1EP49674 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
CSNK1EP49674 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
CSNK1EP49674 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CSNK1EP49674 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CSNK1EP49674 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CSNK1EP49674 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
CSNK1EP49674 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
CSNK1EP49674 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CSNK1EP49674 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CSNK1EP49674 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CSNK1EP49674 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CSNK1EP49674 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CSNK1EP49674 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CSNK1EP49674 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CSNK1EP49674 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CSNK1EP49674 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CSNK1EP49674 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CSNK1EP49674 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CSNK1EP49674 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CSNK1EP49674 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CSNK1EP49674 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CSNK1EP49674 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CSNK1EP49674 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CSNK1EP49674 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CSNK1EP49674 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CSNK1EP49674 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CSNK1EP49674 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CSNK1EP49674 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CSNK1EP49674 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CSNK1EP49674 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CSNK1EP49674 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CSNK1EP49674 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CSNK1EP49674 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CSNK1EP49674 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CSNK1EP49674 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CSNK1EP49674 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CSNK1EP49674 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CSNK1EP49674 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CSNK1EP49674 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CSNK1EP49674 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CSNK1EP49674 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CSNK1EP49674 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CSNK1EP49674 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CSNK1EP49674 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CSNK1EP49674 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CSNK1EP49674 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CSNK1EP49674 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CSNK1EP49674 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CSNK1EP49674 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CSNK1EP49674 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CSNK1EP49674 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CSNK1EP49674 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CSNK1EP49674 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CSNK1EP49674 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CSNK1EP49674 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CSNK1EP49674 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CSNK1EP49674 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CSNK1EP49674 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CSNK1EP49674 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CSNK1EP49674 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CSNK1EP49674 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CSNK1EP49674 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CSNK1EP49674 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CSNK1EP49674 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CSNK1EP49674 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CSNK1EP49674 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CSNK1EP49674 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CSNK1EP49674 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CSNK1EP49674 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CSNK1EP49674 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CSNK1EP49674 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CSNK1EP49674 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CSNK1EP49674 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CSNK1EP49674 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CSNK1EP49674 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CSNK1EP49674 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CSNK1EP49674 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CSNK1EP49674 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CSNK1EP49674 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CSNK1EP49674 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CSNK1EP49674 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CSNK1EP49674 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CSNK1EP49674 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CSNK1EP49674 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CSNK1EP49674 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CSNK1EP49674 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CSNK1EP49674 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CSNK1EP49674 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CSNK1EP49674 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CSNK1EP49674 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CSNK1EP49674 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CSNK1EP49674 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CSNK1EP49674 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62 ms