Protein–RNA interactions for Protein: P49642

PRIM1, DNA primase small subunit, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRIM1P49642 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PRIM1P49642 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PRIM1P49642 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
PRIM1P49642 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
PRIM1P49642 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
PRIM1P49642 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PRIM1P49642 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PRIM1P49642 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PRIM1P49642 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PRIM1P49642 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PRIM1P49642 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PRIM1P49642 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PRIM1P49642 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.39
PRIM1P49642 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
PRIM1P49642 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
PRIM1P49642 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
PRIM1P49642 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
PRIM1P49642 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
PRIM1P49642 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PRIM1P49642 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PRIM1P49642 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PRIM1P49642 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PRIM1P49642 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PRIM1P49642 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PRIM1P49642 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PRIM1P49642 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PRIM1P49642 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PRIM1P49642 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PRIM1P49642 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PRIM1P49642 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PRIM1P49642 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PRIM1P49642 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PRIM1P49642 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PRIM1P49642 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
PRIM1P49642 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
PRIM1P49642 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PRIM1P49642 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PRIM1P49642 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PRIM1P49642 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PRIM1P49642 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PRIM1P49642 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PRIM1P49642 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PRIM1P49642 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRIM1P49642 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRIM1P49642 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRIM1P49642 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRIM1P49642 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRIM1P49642 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRIM1P49642 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRIM1P49642 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRIM1P49642 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRIM1P49642 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRIM1P49642 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
PRIM1P49642 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRIM1P49642 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRIM1P49642 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRIM1P49642 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRIM1P49642 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRIM1P49642 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRIM1P49642 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
PRIM1P49642 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
PRIM1P49642 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRIM1P49642 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRIM1P49642 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRIM1P49642 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRIM1P49642 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRIM1P49642 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRIM1P49642 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRIM1P49642 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRIM1P49642 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRIM1P49642 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRIM1P49642 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRIM1P49642 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRIM1P49642 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRIM1P49642 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRIM1P49642 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRIM1P49642 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRIM1P49642 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRIM1P49642 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRIM1P49642 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRIM1P49642 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
PRIM1P49642 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
PRIM1P49642 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
PRIM1P49642 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRIM1P49642 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRIM1P49642 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRIM1P49642 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRIM1P49642 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRIM1P49642 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRIM1P49642 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRIM1P49642 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRIM1P49642 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRIM1P49642 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRIM1P49642 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRIM1P49642 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRIM1P49642 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRIM1P49642 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRIM1P49642 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRIM1P49642 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRIM1P49642 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms