Protein–RNA interactions for Protein: P43026

GDF5, Growth/differentiation factor 5, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDF5P43026 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GDF5P43026 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GDF5P43026 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GDF5P43026 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GDF5P43026 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GDF5P43026 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GDF5P43026 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GDF5P43026 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GDF5P43026 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GDF5P43026 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GDF5P43026 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GDF5P43026 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GDF5P43026 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GDF5P43026 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GDF5P43026 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
GDF5P43026 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GDF5P43026 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GDF5P43026 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GDF5P43026 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GDF5P43026 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GDF5P43026 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GDF5P43026 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GDF5P43026 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GDF5P43026 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GDF5P43026 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GDF5P43026 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GDF5P43026 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GDF5P43026 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GDF5P43026 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GDF5P43026 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
GDF5P43026 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GDF5P43026 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GDF5P43026 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GDF5P43026 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GDF5P43026 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GDF5P43026 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GDF5P43026 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GDF5P43026 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GDF5P43026 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GDF5P43026 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GDF5P43026 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GDF5P43026 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GDF5P43026 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GDF5P43026 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GDF5P43026 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GDF5P43026 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GDF5P43026 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GDF5P43026 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GDF5P43026 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GDF5P43026 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GDF5P43026 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GDF5P43026 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
GDF5P43026 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GDF5P43026 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GDF5P43026 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GDF5P43026 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GDF5P43026 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GDF5P43026 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GDF5P43026 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
GDF5P43026 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GDF5P43026 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GDF5P43026 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GDF5P43026 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GDF5P43026 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GDF5P43026 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GDF5P43026 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GDF5P43026 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
GDF5P43026 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GDF5P43026 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GDF5P43026 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GDF5P43026 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GDF5P43026 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GDF5P43026 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GDF5P43026 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GDF5P43026 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GDF5P43026 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GDF5P43026 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GDF5P43026 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GDF5P43026 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GDF5P43026 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GDF5P43026 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GDF5P43026 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GDF5P43026 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GDF5P43026 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GDF5P43026 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GDF5P43026 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GDF5P43026 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GDF5P43026 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GDF5P43026 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GDF5P43026 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
GDF5P43026 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GDF5P43026 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GDF5P43026 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GDF5P43026 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GDF5P43026 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GDF5P43026 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GDF5P43026 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GDF5P43026 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GDF5P43026 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
GDF5P43026 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.7 ms