Protein–RNA interactions for Protein: P39905

GDNF, Glial cell line-derived neurotrophic factor, humanhuman

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Length 211 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDNFP39905 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GDNFP39905 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GDNFP39905 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GDNFP39905 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GDNFP39905 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GDNFP39905 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GDNFP39905 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GDNFP39905 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GDNFP39905 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GDNFP39905 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GDNFP39905 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GDNFP39905 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GDNFP39905 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GDNFP39905 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GDNFP39905 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GDNFP39905 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GDNFP39905 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GDNFP39905 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
GDNFP39905 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GDNFP39905 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GDNFP39905 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GDNFP39905 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GDNFP39905 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GDNFP39905 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
GDNFP39905 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GDNFP39905 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GDNFP39905 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GDNFP39905 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GDNFP39905 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GDNFP39905 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GDNFP39905 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GDNFP39905 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GDNFP39905 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GDNFP39905 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GDNFP39905 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GDNFP39905 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GDNFP39905 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GDNFP39905 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GDNFP39905 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GDNFP39905 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GDNFP39905 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GDNFP39905 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GDNFP39905 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GDNFP39905 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
GDNFP39905 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GDNFP39905 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GDNFP39905 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GDNFP39905 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GDNFP39905 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GDNFP39905 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GDNFP39905 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GDNFP39905 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GDNFP39905 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GDNFP39905 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GDNFP39905 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GDNFP39905 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GDNFP39905 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GDNFP39905 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GDNFP39905 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GDNFP39905 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
GDNFP39905 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GDNFP39905 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
GDNFP39905 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GDNFP39905 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
GDNFP39905 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GDNFP39905 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
GDNFP39905 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GDNFP39905 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GDNFP39905 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
GDNFP39905 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GDNFP39905 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GDNFP39905 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GDNFP39905 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GDNFP39905 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GDNFP39905 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GDNFP39905 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GDNFP39905 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GDNFP39905 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GDNFP39905 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GDNFP39905 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GDNFP39905 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GDNFP39905 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GDNFP39905 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GDNFP39905 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GDNFP39905 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GDNFP39905 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GDNFP39905 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GDNFP39905 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GDNFP39905 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GDNFP39905 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GDNFP39905 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GDNFP39905 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GDNFP39905 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GDNFP39905 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GDNFP39905 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GDNFP39905 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GDNFP39905 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GDNFP39905 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GDNFP39905 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GDNFP39905 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
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