Protein–RNA interactions for Protein: P35609

ACTN2, Alpha-actinin-2, humanhuman

Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN2P35609 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ACTN2P35609 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ACTN2P35609 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ACTN2P35609 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ACTN2P35609 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ACTN2P35609 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ACTN2P35609 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ACTN2P35609 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ACTN2P35609 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ACTN2P35609 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ACTN2P35609 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ACTN2P35609 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ACTN2P35609 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ACTN2P35609 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ACTN2P35609 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ACTN2P35609 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ACTN2P35609 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ACTN2P35609 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ACTN2P35609 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ACTN2P35609 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ACTN2P35609 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ACTN2P35609 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ACTN2P35609 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ACTN2P35609 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ACTN2P35609 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ACTN2P35609 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ACTN2P35609 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ACTN2P35609 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ACTN2P35609 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ACTN2P35609 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ACTN2P35609 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ACTN2P35609 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ACTN2P35609 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ACTN2P35609 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ACTN2P35609 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ACTN2P35609 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ACTN2P35609 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ACTN2P35609 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ACTN2P35609 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ACTN2P35609 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
ACTN2P35609 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
ACTN2P35609 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
ACTN2P35609 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ACTN2P35609 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ACTN2P35609 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ACTN2P35609 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ACTN2P35609 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ACTN2P35609 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ACTN2P35609 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ACTN2P35609 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ACTN2P35609 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ACTN2P35609 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ACTN2P35609 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ACTN2P35609 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ACTN2P35609 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ACTN2P35609 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ACTN2P35609 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ACTN2P35609 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ACTN2P35609 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ACTN2P35609 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ACTN2P35609 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ACTN2P35609 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ACTN2P35609 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ACTN2P35609 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ACTN2P35609 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ACTN2P35609 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ACTN2P35609 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ACTN2P35609 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ACTN2P35609 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ACTN2P35609 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ACTN2P35609 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ACTN2P35609 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ACTN2P35609 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ACTN2P35609 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ACTN2P35609 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ACTN2P35609 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ACTN2P35609 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
ACTN2P35609 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
ACTN2P35609 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
ACTN2P35609 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
ACTN2P35609 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
ACTN2P35609 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ACTN2P35609 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ACTN2P35609 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ACTN2P35609 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ACTN2P35609 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
ACTN2P35609 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ACTN2P35609 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ACTN2P35609 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ACTN2P35609 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
ACTN2P35609 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ACTN2P35609 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ACTN2P35609 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ACTN2P35609 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ACTN2P35609 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ACTN2P35609 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ACTN2P35609 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ACTN2P35609 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
ACTN2P35609 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ACTN2P35609 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms