Protein–RNA interactions for Protein: P34130

NTF4, Neurotrophin-4, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTF4P34130 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NTF4P34130 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NTF4P34130 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NTF4P34130 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NTF4P34130 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NTF4P34130 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NTF4P34130 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NTF4P34130 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NTF4P34130 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NTF4P34130 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NTF4P34130 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NTF4P34130 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NTF4P34130 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NTF4P34130 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NTF4P34130 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NTF4P34130 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NTF4P34130 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NTF4P34130 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NTF4P34130 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NTF4P34130 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NTF4P34130 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NTF4P34130 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NTF4P34130 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NTF4P34130 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NTF4P34130 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NTF4P34130 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NTF4P34130 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NTF4P34130 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NTF4P34130 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NTF4P34130 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NTF4P34130 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NTF4P34130 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
NTF4P34130 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NTF4P34130 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NTF4P34130 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NTF4P34130 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NTF4P34130 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NTF4P34130 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NTF4P34130 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NTF4P34130 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NTF4P34130 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NTF4P34130 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
NTF4P34130 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
NTF4P34130 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NTF4P34130 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NTF4P34130 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NTF4P34130 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NTF4P34130 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NTF4P34130 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NTF4P34130 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NTF4P34130 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NTF4P34130 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NTF4P34130 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NTF4P34130 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
NTF4P34130 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NTF4P34130 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NTF4P34130 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NTF4P34130 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NTF4P34130 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NTF4P34130 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NTF4P34130 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NTF4P34130 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NTF4P34130 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NTF4P34130 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NTF4P34130 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NTF4P34130 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NTF4P34130 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NTF4P34130 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NTF4P34130 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
NTF4P34130 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NTF4P34130 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NTF4P34130 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
NTF4P34130 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NTF4P34130 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NTF4P34130 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NTF4P34130 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
NTF4P34130 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NTF4P34130 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
NTF4P34130 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NTF4P34130 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NTF4P34130 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NTF4P34130 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NTF4P34130 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NTF4P34130 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NTF4P34130 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NTF4P34130 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NTF4P34130 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NTF4P34130 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NTF4P34130 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
NTF4P34130 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
NTF4P34130 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NTF4P34130 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NTF4P34130 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NTF4P34130 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NTF4P34130 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NTF4P34130 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NTF4P34130 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NTF4P34130 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
NTF4P34130 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NTF4P34130 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms