Protein–RNA interactions for Protein: P31327

CPS1, Carbamoyl-phosphate synthase [ammonia], mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPS1P31327 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CPS1P31327 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CPS1P31327 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CPS1P31327 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CPS1P31327 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CPS1P31327 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CPS1P31327 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CPS1P31327 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CPS1P31327 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CPS1P31327 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CPS1P31327 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CPS1P31327 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CPS1P31327 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CPS1P31327 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CPS1P31327 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CPS1P31327 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CPS1P31327 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
CPS1P31327 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CPS1P31327 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CPS1P31327 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CPS1P31327 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CPS1P31327 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CPS1P31327 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CPS1P31327 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CPS1P31327 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
CPS1P31327 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CPS1P31327 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
CPS1P31327 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CPS1P31327 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
CPS1P31327 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
CPS1P31327 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CPS1P31327 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CPS1P31327 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CPS1P31327 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CPS1P31327 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CPS1P31327 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CPS1P31327 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CPS1P31327 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CPS1P31327 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CPS1P31327 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CPS1P31327 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CPS1P31327 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CPS1P31327 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CPS1P31327 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CPS1P31327 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CPS1P31327 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CPS1P31327 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CPS1P31327 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CPS1P31327 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CPS1P31327 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
CPS1P31327 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CPS1P31327 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
CPS1P31327 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CPS1P31327 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CPS1P31327 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CPS1P31327 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
CPS1P31327 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CPS1P31327 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CPS1P31327 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CPS1P31327 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CPS1P31327 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CPS1P31327 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CPS1P31327 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CPS1P31327 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CPS1P31327 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CPS1P31327 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CPS1P31327 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CPS1P31327 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CPS1P31327 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CPS1P31327 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CPS1P31327 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CPS1P31327 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CPS1P31327 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CPS1P31327 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CPS1P31327 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CPS1P31327 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CPS1P31327 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CPS1P31327 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CPS1P31327 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CPS1P31327 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CPS1P31327 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CPS1P31327 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CPS1P31327 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CPS1P31327 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CPS1P31327 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CPS1P31327 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CPS1P31327 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CPS1P31327 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CPS1P31327 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CPS1P31327 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CPS1P31327 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
CPS1P31327 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CPS1P31327 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CPS1P31327 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CPS1P31327 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CPS1P31327 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CPS1P31327 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
CPS1P31327 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
CPS1P31327 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CPS1P31327 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms