Protein–RNA interactions for Protein: P31276

HOXC13, Homeobox protein Hox-C13, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC13P31276 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HOXC13P31276 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HOXC13P31276 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HOXC13P31276 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HOXC13P31276 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HOXC13P31276 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HOXC13P31276 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HOXC13P31276 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HOXC13P31276 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HOXC13P31276 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HOXC13P31276 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HOXC13P31276 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HOXC13P31276 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HOXC13P31276 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HOXC13P31276 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HOXC13P31276 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HOXC13P31276 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HOXC13P31276 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HOXC13P31276 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HOXC13P31276 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HOXC13P31276 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
HOXC13P31276 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
HOXC13P31276 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HOXC13P31276 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HOXC13P31276 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HOXC13P31276 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HOXC13P31276 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
HOXC13P31276 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HOXC13P31276 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HOXC13P31276 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HOXC13P31276 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HOXC13P31276 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
HOXC13P31276 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HOXC13P31276 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HOXC13P31276 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HOXC13P31276 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HOXC13P31276 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HOXC13P31276 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HOXC13P31276 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HOXC13P31276 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
HOXC13P31276 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HOXC13P31276 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
HOXC13P31276 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HOXC13P31276 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
HOXC13P31276 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
HOXC13P31276 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
HOXC13P31276 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HOXC13P31276 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HOXC13P31276 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
HOXC13P31276 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
HOXC13P31276 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
HOXC13P31276 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
HOXC13P31276 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
HOXC13P31276 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
HOXC13P31276 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
HOXC13P31276 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
HOXC13P31276 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
HOXC13P31276 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HOXC13P31276 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
HOXC13P31276 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
HOXC13P31276 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
HOXC13P31276 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
HOXC13P31276 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
HOXC13P31276 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HOXC13P31276 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
HOXC13P31276 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
HOXC13P31276 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HOXC13P31276 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HOXC13P31276 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HOXC13P31276 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
HOXC13P31276 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
HOXC13P31276 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HOXC13P31276 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HOXC13P31276 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
HOXC13P31276 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
HOXC13P31276 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
HOXC13P31276 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HOXC13P31276 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HOXC13P31276 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
HOXC13P31276 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
HOXC13P31276 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
HOXC13P31276 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
HOXC13P31276 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
HOXC13P31276 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HOXC13P31276 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
HOXC13P31276 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
HOXC13P31276 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HOXC13P31276 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HOXC13P31276 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC18.88■□□□□ 0.61
HOXC13P31276 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
HOXC13P31276 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HOXC13P31276 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HOXC13P31276 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HOXC13P31276 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HOXC13P31276 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
HOXC13P31276 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
HOXC13P31276 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HOXC13P31276 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HOXC13P31276 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
HOXC13P31276 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms